108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2786 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  100 
 
 
355 aa  734    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  41.84 
 
 
342 aa  295  6e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  41.47 
 
 
342 aa  291  9e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  40.59 
 
 
342 aa  288  9e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  39.82 
 
 
341 aa  281  8.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  37.72 
 
 
348 aa  264  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  34.1 
 
 
339 aa  205  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  31.1 
 
 
338 aa  189  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.67 
 
 
339 aa  166  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.45 
 
 
344 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.75 
 
 
339 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.79 
 
 
345 aa  150  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.98 
 
 
367 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.3 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  27.06 
 
 
349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.06 
 
 
341 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  26.09 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  25.44 
 
 
348 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  31.75 
 
 
287 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0079  uroporphyrinogen decarboxylase  31.28 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0659182  hitchhiker  0.00575431 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  25.21 
 
 
372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1823  uroporphyrinogen decarboxylase  30.81 
 
 
287 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.952283  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.94 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  26.12 
 
 
358 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  24.79 
 
 
357 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0422  uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  27.93 
 
 
293 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  26.65 
 
 
337 aa  97.1  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  22.7 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  26.98 
 
 
319 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  24.6 
 
 
556 aa  89.7  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  23.96 
 
 
335 aa  89.4  8e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  25.86 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  21.88 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  20.69 
 
 
363 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26160  hypothetical protein  25 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  20.11 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  20.11 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  23.33 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.53 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  24.88 
 
 
348 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  25.39 
 
 
617 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2111  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like  29.36 
 
 
339 aa  63.5  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  22.49 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  20.87 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  26.49 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  21.83 
 
 
356 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  23.46 
 
 
448 aa  60.1  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0599  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  32.86 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  22.35 
 
 
348 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  25.43 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  22.37 
 
 
314 aa  57  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  25.43 
 
 
339 aa  57  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  22.07 
 
 
352 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0583  uroporphyrinogen decarboxylase  22.67 
 
 
346 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  24.86 
 
 
339 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1200  uroporphyrinogen decarboxylase  21.98 
 
 
347 aa  54.7  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  22.88 
 
 
335 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  21.78 
 
 
355 aa  53.1  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46716  uroporphyrinogen decarboxylase  24.7 
 
 
362 aa  52.8  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00457298 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  24.71 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2887  uroporphyrinogen decarboxylase  24.4 
 
 
354 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12950  Uroporphyrinogen-III decarboxylase  21.5 
 
 
380 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000558347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  23.18 
 
 
354 aa  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  22.75 
 
 
340 aa  49.7  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  25.64 
 
 
340 aa  49.3  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  24.58 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0968  uroporphyrinogen decarboxylase  26.16 
 
 
324 aa  48.9  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3769  uroporphyrinogen decarboxylase  23.95 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.0130148 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  21.52 
 
 
346 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06091  uroporphyrinogen decarboxylase  21.51 
 
 
346 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.633731  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03630  uroporphyrinogen decarboxylase  22.34 
 
 
343 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  25.67 
 
 
339 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  20.6 
 
 
355 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  22.09 
 
 
351 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  21.22 
 
 
346 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  24.43 
 
 
353 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10691  uroporphyrinogen decarboxylase  21.59 
 
 
351 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.88253  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  22.22 
 
 
355 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0010  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  23.7 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0946  uroporphyrinogen decarboxylase  24.32 
 
 
341 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  21.88 
 
 
359 aa  47  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2932  hypothetical protein  23.35 
 
 
397 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  22.57 
 
 
356 aa  46.6  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  25.17 
 
 
351 aa  46.6  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  22.16 
 
 
355 aa  46.2  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  21.78 
 
 
351 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  21.91 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4014  uroporphyrinogen decarboxylase  23.08 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.0629126 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0030  uroporphyrinogen decarboxylase  22.97 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  22.09 
 
 
351 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  21.15 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  22.12 
 
 
354 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  21.21 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17656  predicted protein  22.34 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0099841  normal  0.0141903 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  24.29 
 
 
367 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  24.84 
 
 
342 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0134  uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.94 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  20.67 
 
 
354 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  21.86 
 
 
367 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1013  uroporphyrinogen decarboxylase  23.29 
 
 
340 aa  43.9  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>