More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03630 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03630  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 343 aa  714    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0946  uroporphyrinogen decarboxylase  75 
 
 		 341 aa  541  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  71.26 
 
 		 341 aa  520  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  59.29 
 
 		 341 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  45.61 
 
 		 353 aa  340  1e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  46.57 
 
 		 351 aa  334  2e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  45.14 
 
 		 351 aa  331  9e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  47.81 
 
 		 342 aa  329  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  46.61 
 
 		 339 aa  329  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  44.86 
 
 		 351 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  45.14 
 
 		 351 aa  328  7e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 351 aa  325  6e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0774  uroporphyrinogen decarboxylase  46.49 
 
 		 344 aa  325  6e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  45.56 
 
 		 354 aa  325  7e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  43.84 
 
 		 354 aa  323  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  44.86 
 
 		 351 aa  323  3e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  45.24 
 
 		 352 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  44.86 
 
 		 351 aa  323  3e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  45.48 
 
 		 352 aa  322  8e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  44.06 
 
 		 354 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  44.8 
 
 		 355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  43.55 
 
 		 354 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  43.27 
 
 		 354 aa  318  9e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 354 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  43.9 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  44.7 
 
 		 354 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  45.22 
 
 		 354 aa  316  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  43.9 
 
 		 354 aa  316  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  43.9 
 
 		 354 aa  316  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  43.9 
 
 		 354 aa  316  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  44.41 
 
 		 354 aa  316  3e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  44.44 
 
 		 354 aa  315  6e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  43.27 
 
 		 355 aa  315  6e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 354 aa  315  7e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  44.9 
 
 		 353 aa  315  7e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  44.41 
 
 		 354 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  44.64 
 
 		 354 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  44.7 
 
 		 354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46716  uroporphyrinogen decarboxylase  44.1 
 
 		 362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00457298 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0689  uroporphyrinogen decarboxylase  43.66 
 
 		 354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  44.22 
 
 		 355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  43.93 
 
 		 355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  43.93 
 
 		 359 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  42.9 
 
 		 354 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  43.93 
 
 		 355 aa  312  5.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0609  uroporphyrinogen decarboxylase  43.38 
 
 		 354 aa  311  9e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  44.41 
 
 		 354 aa  311  9e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  43.77 
 
 		 357 aa  311  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  44.7 
 
 		 402 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  44.7 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  43.9 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  45.43 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  43.77 
 
 		 357 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 354 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  44.13 
 
 		 354 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  44.41 
 
 		 354 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  43.9 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  43.9 
 
 		 355 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  45.43 
 
 		 355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  43.27 
 
 		 354 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 354 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  42.41 
 
 		 354 aa  309  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 354 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 354 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.91714 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  45.27 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 354 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  44.29 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  42.69 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  43.48 
 
 		 354 aa  306  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02733  uroporphyrinogen decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_1G05060)  44.48 
 
 		 363 aa  306  4.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  44.73 
 
 		 355 aa  306  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3039  uroporphyrinogen decarboxylase  41.81 
 
 		 360 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  43.19 
 
 		 360 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  42.9 
 
 		 380 aa  305  9.000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  45.01 
 
 		 354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  43.59 
 
 		 354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  42.9 
 
 		 364 aa  302  5.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 		 354 aa  302  5.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  42.36 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 354 aa  298  8e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 354 aa  298  8e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  43.14 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  44.87 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 354 aa  296  4e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02179  uroporphyrinogen decarboxylase  40.85 
 
 		 354 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3890  uroporphyrinogen decarboxylase  41.71 
 
 		 366 aa  292  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  42.52 
 
 		 350 aa  292  7e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  41.5 
 
 		 355 aa  291  8e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  42.11 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>