More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0689 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0609  uroporphyrinogen decarboxylase  99.15 
 
 		 354 aa  719    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884937  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0689  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 354 aa  726    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02179  uroporphyrinogen decarboxylase  81.07 
 
 		 354 aa  570  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3039  uroporphyrinogen decarboxylase  72.52 
 
 		 360 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  59.89 
 
 		 351 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  56.37 
 
 		 354 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  60.45 
 
 		 365 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  57.39 
 
 		 355 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  56.98 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  58.24 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  57.39 
 
 		 365 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  58.07 
 
 		 353 aa  411  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  58.05 
 
 		 354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  56.09 
 
 		 380 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  58.05 
 
 		 354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  55.56 
 
 		 354 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  56.41 
 
 		 354 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  56.13 
 
 		 354 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  55.4 
 
 		 354 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  56.13 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  55.84 
 
 		 354 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  55.24 
 
 		 354 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  56.82 
 
 		 354 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  56.25 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  55.84 
 
 		 354 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  56.82 
 
 		 354 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  55.97 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  55.27 
 
 		 354 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  55.06 
 
 		 367 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  54.7 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  55.56 
 
 		 354 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  55.97 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  54.78 
 
 		 367 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  55.4 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  55.84 
 
 		 354 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  56.13 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  54.7 
 
 		 354 aa  396  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0705  uroporphyrinogen decarboxylase  55.81 
 
 		 365 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  55.68 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  56.66 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  53.98 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  54.67 
 
 		 354 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  54.7 
 
 		 354 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  56.53 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3524  uroporphyrinogen decarboxylase  54.39 
 
 		 356 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  54.67 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  54.67 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  54.42 
 
 		 364 aa  391  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  54.67 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3303  uroporphyrinogen decarboxylase  54.78 
 
 		 364 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0163615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  54.39 
 
 		 354 aa  391  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  54.39 
 
 		 354 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  55.97 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  54.67 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  54.37 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  54.26 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  54.39 
 
 		 354 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3292  uroporphyrinogen decarboxylase  54.62 
 
 		 392 aa  391  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.136246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  54.67 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  54.67 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  54.67 
 
 		 354 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  54.39 
 
 		 354 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  55.84 
 
 		 357 aa  391  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3491  uroporphyrinogen decarboxylase  54.34 
 
 		 367 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000153179  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  54.67 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  54.67 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2944  uroporphyrinogen decarboxylase  54.9 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0032555  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  55.84 
 
 		 354 aa  393  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  54.67 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  54.67 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0111  uroporphyrinogen decarboxylase  54.9 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0979299  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  54.67 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0110  uroporphyrinogen decarboxylase  54.47 
 
 		 375 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  54.99 
 
 		 354 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  53.28 
 
 		 354 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  52.99 
 
 		 352 aa  388  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  52.71 
 
 		 353 aa  388  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  52.99 
 
 		 354 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  54.55 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3342  uroporphyrinogen decarboxylase  54.06 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  55.18 
 
 		 364 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  54.99 
 
 		 354 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3890  uroporphyrinogen decarboxylase  53.22 
 
 		 366 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  53.5 
 
 		 366 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  55.18 
 
 		 364 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  54.99 
 
 		 354 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  54.67 
 
 		 354 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  54.47 
 
 		 392 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  55.68 
 
 		 355 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  55.27 
 
 		 354 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3023  uroporphyrinogen decarboxylase  53.22 
 
 		 378 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  54.99 
 
 		 354 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  54.99 
 
 		 354 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0134  uroporphyrinogen decarboxylase  54.47 
 
 		 372 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106114  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  54.9 
 
 		 364 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  55.18 
 
 		 364 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  55.68 
 
 		 355 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0112  uroporphyrinogen decarboxylase  53.78 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0126  uroporphyrinogen decarboxylase  54.34 
 
 		 375 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  54.11 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>