More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_46716 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_46716  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 362 aa  749    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00457298 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02733  uroporphyrinogen decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_1G05060)  64.56 
 
 		 363 aa  488  1e-137  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  49.58 
 
 		 353 aa  362  6e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00030  uroporphyrinogen decarboxylase, putative  47.95 
 
 		 380 aa  351  1e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000569927  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  45.22 
 
 		 341 aa  325  8.000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03630  uroporphyrinogen decarboxylase  44.1 
 
 		 343 aa  313  3.9999999999999997e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  45.38 
 
 		 342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  44.25 
 
 		 339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0774  uroporphyrinogen decarboxylase  44.92 
 
 		 344 aa  296  3e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0946  uroporphyrinogen decarboxylase  42.66 
 
 		 341 aa  295  9e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1502  uroporphyrinogen decarboxylase  41.82 
 
 		 378 aa  289  6e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  42.13 
 
 		 341 aa  288  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1681  uroporphyrinogen decarboxylase  41.55 
 
 		 378 aa  288  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  40.51 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  41.53 
 
 		 352 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 		 355 aa  284  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  39.77 
 
 		 354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  39.89 
 
 		 357 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  40.23 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1599  uroporphyrinogen decarboxylase  41.6 
 
 		 368 aa  281  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586302  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  40.06 
 
 		 355 aa  279  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  39.94 
 
 		 355 aa  278  9e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  39.72 
 
 		 354 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  39.61 
 
 		 354 aa  276  6e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  38.33 
 
 		 354 aa  275  8e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  40.56 
 
 		 351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  38.33 
 
 		 354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  38.33 
 
 		 354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  39.83 
 
 		 351 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  39.38 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  40.51 
 
 		 354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  38.89 
 
 		 354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 365 aa  272  7e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1118  uroporphyrinogen decarboxylase  38.33 
 
 		 366 aa  272  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3039  uroporphyrinogen decarboxylase  40.66 
 
 		 360 aa  271  9e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  38.66 
 
 		 354 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  39.38 
 
 		 355 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  39.17 
 
 		 354 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  39.66 
 
 		 354 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  39.17 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  39.17 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  39.44 
 
 		 354 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  38.98 
 
 		 351 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02179  uroporphyrinogen decarboxylase  42.18 
 
 		 354 aa  269  7e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  38.7 
 
 		 351 aa  268  8e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  38.33 
 
 		 354 aa  268  8e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  38.33 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0689  uroporphyrinogen decarboxylase  41.62 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  38.98 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  38.66 
 
 		 354 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  38.33 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  38.33 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  38.81 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  38.33 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  38.42 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  39.55 
 
 		 351 aa  266  4e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 354 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  38.24 
 
 		 360 aa  266  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  38.38 
 
 		 380 aa  266  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0609  uroporphyrinogen decarboxylase  41.34 
 
 		 354 aa  265  1e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884937  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 354 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  38.42 
 
 		 353 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  38.11 
 
 		 356 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  38.83 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  37.82 
 
 		 354 aa  263  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 354 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  37.57 
 
 		 351 aa  263  4e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  37.82 
 
 		 354 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  38.33 
 
 		 354 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  37.54 
 
 		 354 aa  262  8e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  37.54 
 
 		 354 aa  262  8e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  37.54 
 
 		 354 aa  262  8e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  37.54 
 
 		 354 aa  262  8e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  37.54 
 
 		 354 aa  262  8e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  37.54 
 
 		 354 aa  262  8e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  37.54 
 
 		 354 aa  262  8e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  37.54 
 
 		 354 aa  262  8e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  37.54 
 
 		 354 aa  262  8e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  37.82 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  37.96 
 
 		 357 aa  261  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3524  uroporphyrinogen decarboxylase  37.5 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  37.54 
 
 		 354 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 354 aa  260  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  37.82 
 
 		 354 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3861  uroporphyrinogen decarboxylase  37.94 
 
 		 370 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  37.82 
 
 		 354 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  37.82 
 
 		 355 aa  258  8e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  37.54 
 
 		 354 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  37.02 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  37.78 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  38.14 
 
 		 354 aa  258  2e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3134  uroporphyrinogen decarboxylase  37.94 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 355 aa  257  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  37.78 
 
 		 355 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  37.78 
 
 		 355 aa  256  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3890  uroporphyrinogen decarboxylase  37.33 
 
 		 366 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  40.56 
 
 		 361 aa  255  8e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  40.56 
 
 		 402 aa  255  9e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  38.38 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>