More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0130 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  87.18 
 
 		 351 aa  647    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  90.88 
 
 		 351 aa  667    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 351 aa  729    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  83.48 
 
 		 351 aa  632  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  83.76 
 
 		 351 aa  631  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  84.05 
 
 		 351 aa  629  1e-179  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  84.05 
 
 		 351 aa  630  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  51.56 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  50.14 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  48.43 
 
 		 353 aa  364  1e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  50.56 
 
 		 355 aa  362  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  51.98 
 
 		 355 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  50.42 
 
 		 354 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 		 355 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 		 355 aa  359  4e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  49.58 
 
 		 354 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  49.72 
 
 		 355 aa  358  5e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  50.14 
 
 		 354 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  49.42 
 
 		 353 aa  358  7e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  50.14 
 
 		 354 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  52.46 
 
 		 339 aa  358  9e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  47.86 
 
 		 352 aa  357  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  49.86 
 
 		 354 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  49.57 
 
 		 356 aa  356  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  49.01 
 
 		 354 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  50.14 
 
 		 354 aa  355  5.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  49.58 
 
 		 354 aa  353  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  48.72 
 
 		 351 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  49.01 
 
 		 354 aa  352  4e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  48.16 
 
 		 354 aa  352  5e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  49.86 
 
 		 357 aa  352  8e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  50.14 
 
 		 355 aa  351  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  48.44 
 
 		 359 aa  350  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  48.44 
 
 		 354 aa  349  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  48.44 
 
 		 354 aa  349  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  48.44 
 
 		 354 aa  349  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  48.44 
 
 		 354 aa  349  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  48.44 
 
 		 354 aa  349  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  48.44 
 
 		 354 aa  349  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  48.44 
 
 		 354 aa  349  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  48.44 
 
 		 354 aa  349  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  48.73 
 
 		 355 aa  348  7e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  48.16 
 
 		 355 aa  348  8e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  48.16 
 
 		 354 aa  347  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  48.73 
 
 		 354 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  48.44 
 
 		 354 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  48.16 
 
 		 354 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  49.01 
 
 		 354 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  47.03 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  47.88 
 
 		 380 aa  347  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  48.59 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  47.88 
 
 		 354 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  47.88 
 
 		 354 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  48.73 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  49.57 
 
 		 402 aa  343  2e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  49.57 
 
 		 361 aa  344  2e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  47.88 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  47.88 
 
 		 354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  49.57 
 
 		 356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  48.16 
 
 		 365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  48.44 
 
 		 354 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  49.43 
 
 		 342 aa  342  7e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  48.73 
 
 		 355 aa  342  7e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  48.73 
 
 		 355 aa  342  8e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  48.73 
 
 		 355 aa  342  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  47.59 
 
 		 353 aa  341  9e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  48.41 
 
 		 350 aa  340  2e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  47.38 
 
 		 341 aa  340  2e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  47.59 
 
 		 354 aa  340  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  49.15 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  47.31 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02179  uroporphyrinogen decarboxylase  48.02 
 
 		 354 aa  339  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  48.41 
 
 		 352 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  47.88 
 
 		 354 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  47.88 
 
 		 354 aa  339  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0774  uroporphyrinogen decarboxylase  48.28 
 
 		 344 aa  337  9.999999999999999e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  49.15 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0689  uroporphyrinogen decarboxylase  48.59 
 
 		 354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  48.87 
 
 		 366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  47.59 
 
 		 354 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3890  uroporphyrinogen decarboxylase  48.59 
 
 		 366 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  48.31 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  48.31 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2962  uroporphyrinogen decarboxylase  48.31 
 
 		 405 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  48.31 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3292  uroporphyrinogen decarboxylase  48.59 
 
 		 392 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.136246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  48.31 
 
 		 364 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  48.31 
 
 		 364 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0170  uroporphyrinogen decarboxylase  48.31 
 
 		 405 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  46.74 
 
 		 354 aa  333  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3039  uroporphyrinogen decarboxylase  47.88 
 
 		 360 aa  333  3e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  48.26 
 
 		 341 aa  333  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0112  uroporphyrinogen decarboxylase  48.59 
 
 		 392 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  47.03 
 
 		 354 aa  333  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  49.43 
 
 		 354 aa  333  4e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3023  uroporphyrinogen decarboxylase  48.59 
 
 		 378 aa  332  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0126  uroporphyrinogen decarboxylase  48.59 
 
 		 375 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  48.31 
 
 		 392 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0110  uroporphyrinogen decarboxylase  48.31 
 
 		 375 aa  332  5e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0111  uroporphyrinogen decarboxylase  48.31 
 
 		 392 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0979299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>