More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_17656 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009366  OSTLU_17656  predicted protein  100 
 
 		 339 aa  708    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0099841  normal  0.0141903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  58.7 
 
 		 349 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  58.93 
 
 		 353 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  56.38 
 
 		 350 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  56.42 
 
 		 354 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  56.42 
 
 		 354 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0918  uroporphyrinogen decarboxylase  57.06 
 
 		 352 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763067  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1086  uroporphyrinogen decarboxylase  55.79 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000970328 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  56.85 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5159  uroporphyrinogen decarboxylase  55.19 
 
 		 350 aa  414  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  55.56 
 
 		 352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18361  uroporphyrinogen decarboxylase  55.36 
 
 		 352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10691  uroporphyrinogen decarboxylase  55.86 
 
 		 351 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.88253  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  54.46 
 
 		 352 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  54.76 
 
 		 352 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06091  uroporphyrinogen decarboxylase  49.85 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.633731  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0583  uroporphyrinogen decarboxylase  49.56 
 
 		 346 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  49.56 
 
 		 346 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  49.85 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19188  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 		 409 aa  370  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28976  predicted protein  51.19 
 
 		 365 aa  361  1e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0707495  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18446  predicted protein  52.63 
 
 		 321 aa  355  5e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20757  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 431 aa  289  5.0000000000000004e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0771142  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  42.48 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  38.94 
 
 		 356 aa  269  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  39.88 
 
 		 348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  41.32 
 
 		 339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  40.42 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  39.82 
 
 		 343 aa  266  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  40.42 
 
 		 340 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  40.18 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  40.8 
 
 		 340 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  38.94 
 
 		 354 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  39.53 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  39.53 
 
 		 380 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  38.24 
 
 		 355 aa  256  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  38.39 
 
 		 360 aa  256  4e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  40.8 
 
 		 339 aa  256  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  42.31 
 
 		 354 aa  255  6e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  38.35 
 
 		 355 aa  255  7e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  40.8 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  37.98 
 
 		 353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  37.94 
 
 		 355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  38.24 
 
 		 359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  39.07 
 
 		 354 aa  252  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  39.07 
 
 		 354 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  39.36 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  38.48 
 
 		 354 aa  248  9e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  35.8 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  38.39 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  38.78 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  38.24 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  37.54 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  38.05 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  35.29 
 
 		 364 aa  245  6.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  37.69 
 
 		 365 aa  245  9e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  38.92 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  39.12 
 
 		 354 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  38.82 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  36.47 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  37.39 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  38.82 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  38.82 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  38.82 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  36.18 
 
 		 352 aa  242  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  36.2 
 
 		 351 aa  243  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 354 aa  242  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  36.36 
 
 		 352 aa  242  6e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0609  uroporphyrinogen decarboxylase  37.61 
 
 		 354 aa  242  7e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884937  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  37.17 
 
 		 354 aa  242  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  37.76 
 
 		 357 aa  242  7.999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0689  uroporphyrinogen decarboxylase  37.61 
 
 		 354 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  38.69 
 
 		 354 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  35.61 
 
 		 352 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  38.69 
 
 		 354 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  38.69 
 
 		 354 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  38.69 
 
 		 354 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  36.5 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  38.39 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  37.5 
 
 		 354 aa  239  5.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  36.87 
 
 		 354 aa  239  5.999999999999999e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  38.39 
 
 		 357 aa  239  5.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 354 aa  238  8e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 354 aa  238  8e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 354 aa  238  8e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  38.1 
 
 		 354 aa  238  8e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 354 aa  238  8e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 354 aa  238  8e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  37.06 
 
 		 360 aa  238  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 354 aa  238  8e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 354 aa  238  8e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 354 aa  238  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  37.46 
 
 		 351 aa  238  9e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02179  uroporphyrinogen decarboxylase  37.9 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  37.13 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  37.94 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  37.87 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>