More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0583 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_06091  uroporphyrinogen decarboxylase  94.8 
 
 
346 aa  678    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.633731  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0583  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 
346 aa  706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  93.06 
 
 
346 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  94.51 
 
 
346 aa  678    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0918  uroporphyrinogen decarboxylase  74.13 
 
 
352 aa  558  1e-158  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763067  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  75.29 
 
 
352 aa  560  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10691  uroporphyrinogen decarboxylase  74.49 
 
 
351 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.88253  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  73.33 
 
 
352 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  73.04 
 
 
352 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18361  uroporphyrinogen decarboxylase  71.8 
 
 
352 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  64.31 
 
 
353 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1086  uroporphyrinogen decarboxylase  63.93 
 
 
354 aa  470  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000970328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  63.08 
 
 
349 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  63.16 
 
 
354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  62.68 
 
 
354 aa  464  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  62.68 
 
 
354 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5159  uroporphyrinogen decarboxylase  62.94 
 
 
350 aa  462  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  61.06 
 
 
350 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19188  uroporphyrinogen decarboxylase  52.77 
 
 
409 aa  388  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17656  predicted protein  49.56 
 
 
339 aa  372  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0099841  normal  0.0141903 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28976  predicted protein  46.97 
 
 
365 aa  351  1e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0707495  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18446  predicted protein  51.08 
 
 
321 aa  350  2e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20757  uroporphyrinogen decarboxylase  41.11 
 
 
431 aa  288  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0771142  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  40.65 
 
 
352 aa  285  9e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  40.47 
 
 
355 aa  276  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  40.47 
 
 
354 aa  275  9e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  40.47 
 
 
355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  39.82 
 
 
340 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  39.82 
 
 
340 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  38.64 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  40.18 
 
 
359 aa  269  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  39.47 
 
 
352 aa  269  5e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  41.93 
 
 
348 aa  267  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  39.47 
 
 
353 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  41.06 
 
 
351 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  39.12 
 
 
354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  39.23 
 
 
340 aa  266  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  39.82 
 
 
355 aa  265  8e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  38.17 
 
 
341 aa  265  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  40.18 
 
 
355 aa  265  8.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  37.87 
 
 
339 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  38.51 
 
 
354 aa  264  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  39.82 
 
 
354 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  40.12 
 
 
354 aa  263  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  39.12 
 
 
354 aa  263  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  37.5 
 
 
348 aa  262  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  39.12 
 
 
354 aa  262  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 
354 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  37.24 
 
 
357 aa  262  8e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  39 
 
 
355 aa  261  8.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  38.71 
 
 
365 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03630  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 
343 aa  260  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  37.76 
 
 
351 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  39.41 
 
 
354 aa  260  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 
351 aa  259  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  39.88 
 
 
351 aa  259  4e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  37.08 
 
 
364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  39.88 
 
 
351 aa  259  6e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 
354 aa  259  6e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 
351 aa  259  7e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 
354 aa  258  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 
354 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 
354 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  38.89 
 
 
355 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 
354 aa  258  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  38.53 
 
 
354 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 
354 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  38.82 
 
 
354 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 
354 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  38.82 
 
 
354 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 
354 aa  258  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  38.89 
 
 
355 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  39.12 
 
 
357 aa  258  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  36.28 
 
 
342 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 
380 aa  257  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  37.17 
 
 
339 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  39 
 
 
354 aa  256  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  39.12 
 
 
354 aa  256  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  35.99 
 
 
343 aa  255  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  39 
 
 
351 aa  256  6e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  38.42 
 
 
354 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  38.24 
 
 
354 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  37.24 
 
 
337 aa  255  8e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  37.24 
 
 
353 aa  255  9e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  38.42 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  38.24 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 
354 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  38.3 
 
 
355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  39 
 
 
351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  38.81 
 
 
354 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  38.42 
 
 
354 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  39.16 
 
 
355 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  37.83 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  38.24 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  38.42 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 
360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  38.24 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  39.16 
 
 
355 aa  253  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  39.22 
 
 
354 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  39.22 
 
 
354 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>