More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28976 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009355  OSTLU_28976  predicted protein  100 
 
 		 365 aa  762    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0707495  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  53.51 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1086  uroporphyrinogen decarboxylase  53.55 
 
 		 354 aa  388  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000970328 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  53.51 
 
 		 354 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  53.85 
 
 		 350 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5159  uroporphyrinogen decarboxylase  54.44 
 
 		 350 aa  381  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  52.05 
 
 		 349 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  53.55 
 
 		 353 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  51.32 
 
 		 354 aa  378  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10691  uroporphyrinogen decarboxylase  50.44 
 
 		 351 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.88253  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0918  uroporphyrinogen decarboxylase  50.15 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763067  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17656  predicted protein  51.19 
 
 		 339 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0099841  normal  0.0141903 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  48.82 
 
 		 352 aa  362  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  48.82 
 
 		 352 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  49.85 
 
 		 352 aa  360  3e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18361  uroporphyrinogen decarboxylase  47.8 
 
 		 352 aa  357  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20757  uroporphyrinogen decarboxylase  51.46 
 
 		 431 aa  355  6.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0771142  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0583  uroporphyrinogen decarboxylase  46.97 
 
 		 346 aa  352  7e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06091  uroporphyrinogen decarboxylase  47.11 
 
 		 346 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.633731  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  46.24 
 
 		 346 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  45.66 
 
 		 346 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19188  uroporphyrinogen decarboxylase  43.06 
 
 		 409 aa  337  9.999999999999999e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18446  predicted protein  46.91 
 
 		 321 aa  311  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  42.31 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  40.36 
 
 		 337 aa  264  1e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  41.25 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  40.3 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  40.47 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  41.06 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  41 
 
 		 380 aa  253  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1599  uroporphyrinogen decarboxylase  40.76 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586302  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  40.06 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  39.88 
 
 		 348 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  40.29 
 
 		 355 aa  252  9.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  39.64 
 
 		 364 aa  250  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  39.22 
 
 		 340 aa  251  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  40.34 
 
 		 354 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  39.17 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  40.06 
 
 		 357 aa  249  5e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  37.35 
 
 		 342 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  38.51 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  40.41 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  36.95 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  40.41 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03630  uroporphyrinogen decarboxylase  36.28 
 
 		 343 aa  247  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  38.81 
 
 		 356 aa  247  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  35.78 
 
 		 351 aa  245  9e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  38.67 
 
 		 352 aa  245  9e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  38.94 
 
 		 354 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  39.76 
 
 		 354 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  38.46 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  39.12 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  38.87 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  39.77 
 
 		 357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  38.94 
 
 		 355 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  38.69 
 
 		 354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  38.39 
 
 		 354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  38.87 
 
 		 354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  38.39 
 
 		 354 aa  243  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  38.39 
 
 		 354 aa  243  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  39.35 
 
 		 354 aa  243  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  38.39 
 
 		 354 aa  242  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  39.88 
 
 		 360 aa  242  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  38.69 
 
 		 354 aa  242  7e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  38.69 
 
 		 354 aa  242  7e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  38.69 
 
 		 354 aa  242  7e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  38.69 
 
 		 354 aa  242  7e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  38.69 
 
 		 354 aa  242  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  38.69 
 
 		 354 aa  242  7e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  38.69 
 
 		 354 aa  242  7e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  34.93 
 
 		 351 aa  242  7e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  38.69 
 
 		 354 aa  242  7e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  38.92 
 
 		 352 aa  242  9e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  39.41 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  35.57 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  38.28 
 
 		 354 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  37.65 
 
 		 341 aa  241  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  35.47 
 
 		 351 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  37.5 
 
 		 340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  40.64 
 
 		 353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  38.35 
 
 		 355 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  38.35 
 
 		 355 aa  239  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  38.35 
 
 		 355 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  37.98 
 
 		 352 aa  239  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  38.39 
 
 		 354 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  39.17 
 
 		 354 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  38.39 
 
 		 354 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  40.06 
 
 		 354 aa  239  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  38.39 
 
 		 354 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  35.47 
 
 		 351 aa  239  5.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  38.39 
 
 		 354 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  39.17 
 
 		 354 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  40.06 
 
 		 365 aa  239  6.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  38.87 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  36.9 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  37.09 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  39.17 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  38.87 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  38.21 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>