More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_18446 on replicon NC_009370
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009370  OSTLU_18446  predicted protein  100 
 
 
321 aa  665    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  57.19 
 
 
353 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  54.66 
 
 
354 aa  375  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  54.83 
 
 
354 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  53.87 
 
 
349 aa  371  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1086  uroporphyrinogen decarboxylase  54.83 
 
 
354 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000970328 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  54.83 
 
 
354 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  53.73 
 
 
352 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  53.73 
 
 
352 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18361  uroporphyrinogen decarboxylase  53.89 
 
 
352 aa  361  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10691  uroporphyrinogen decarboxylase  53.73 
 
 
351 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.88253  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0918  uroporphyrinogen decarboxylase  55.14 
 
 
352 aa  358  5e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763067  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  54.52 
 
 
352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17656  predicted protein  52.63 
 
 
339 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0099841  normal  0.0141903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  50.93 
 
 
350 aa  355  7.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5159  uroporphyrinogen decarboxylase  52.8 
 
 
350 aa  353  2.9999999999999997e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0583  uroporphyrinogen decarboxylase  51.08 
 
 
346 aa  350  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  51.08 
 
 
346 aa  348  7e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06091  uroporphyrinogen decarboxylase  51.08 
 
 
346 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.633731  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  50.46 
 
 
346 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19188  uroporphyrinogen decarboxylase  49.39 
 
 
409 aa  343  2e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28976  predicted protein  46.91 
 
 
365 aa  311  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0707495  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  41.38 
 
 
351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20757  uroporphyrinogen decarboxylase  43.56 
 
 
431 aa  268  1e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0771142  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  41.85 
 
 
354 aa  262  4e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  40.31 
 
 
355 aa  260  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 
354 aa  255  6e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  40.44 
 
 
354 aa  252  7e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  38.56 
 
 
335 aa  251  9.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  39.81 
 
 
380 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  41.85 
 
 
365 aa  249  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  38.85 
 
 
364 aa  249  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  41.27 
 
 
350 aa  249  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  41.08 
 
 
352 aa  248  7e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  41.14 
 
 
354 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  41.14 
 
 
354 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  40.98 
 
 
354 aa  248  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  40.19 
 
 
354 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  40.82 
 
 
354 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1118  uroporphyrinogen decarboxylase  40.13 
 
 
366 aa  246  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  39.37 
 
 
355 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  39.38 
 
 
353 aa  246  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 
355 aa  246  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  40.98 
 
 
354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  40.98 
 
 
354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  40.51 
 
 
354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3524  uroporphyrinogen decarboxylase  38.24 
 
 
356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  40.73 
 
 
355 aa  245  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  39.69 
 
 
354 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  39.31 
 
 
354 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  39.69 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  40.66 
 
 
354 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  39.5 
 
 
354 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  39.87 
 
 
354 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 
354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  39.5 
 
 
354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  39.08 
 
 
360 aa  242  7e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  37.23 
 
 
361 aa  242  7e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  37.23 
 
 
402 aa  242  7e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  38.34 
 
 
359 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4264  uroporphyrinogen decarboxylase  38.51 
 
 
369 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  40.33 
 
 
354 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  41.31 
 
 
354 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  38.34 
 
 
355 aa  240  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  39.08 
 
 
367 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  39.82 
 
 
355 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  39.5 
 
 
356 aa  240  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  39.87 
 
 
354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  37.85 
 
 
357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  39.82 
 
 
355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  39.82 
 
 
355 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  39.06 
 
 
354 aa  239  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  40.33 
 
 
354 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  38.77 
 
 
367 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  40.33 
 
 
354 aa  238  8e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  40.33 
 
 
354 aa  238  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  40.33 
 
 
354 aa  238  8e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  40.33 
 
 
354 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0363  uroporphyrinogen decarboxylase  38.84 
 
 
369 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178148  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  38.15 
 
 
355 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3491  uroporphyrinogen decarboxylase  37.85 
 
 
367 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000153179  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  38.15 
 
 
355 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  38.15 
 
 
355 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3342  uroporphyrinogen decarboxylase  37.54 
 
 
363 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3023  uroporphyrinogen decarboxylase  38.58 
 
 
378 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  39.75 
 
 
355 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  38.46 
 
 
357 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  36.96 
 
 
348 aa  236  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  38.15 
 
 
354 aa  236  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0134  uroporphyrinogen decarboxylase  38.23 
 
 
372 aa  236  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106114  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  37.12 
 
 
355 aa  236  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 
354 aa  235  7e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 
354 aa  235  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  38.27 
 
 
366 aa  235  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 
354 aa  235  7e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  37.85 
 
 
354 aa  235  8e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  37.85 
 
 
354 aa  235  8e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 
354 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  37.85 
 
 
354 aa  235  8e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  37.85 
 
 
354 aa  235  8e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>