More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2317 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 335 aa  672    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  67.67 
 
 		 337 aa  449  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5159  uroporphyrinogen decarboxylase  42.35 
 
 		 350 aa  291  9e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  43.36 
 
 		 350 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19188  uroporphyrinogen decarboxylase  41.33 
 
 		 409 aa  290  3e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  42.01 
 
 		 354 aa  289  5.0000000000000004e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  42.18 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  42.18 
 
 		 354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10691  uroporphyrinogen decarboxylase  41.47 
 
 		 351 aa  285  8e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.88253  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  43.66 
 
 		 352 aa  285  8e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  41.47 
 
 		 352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  41.18 
 
 		 352 aa  282  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0918  uroporphyrinogen decarboxylase  42.48 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  41.76 
 
 		 353 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18361  uroporphyrinogen decarboxylase  41.4 
 
 		 352 aa  278  9e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1086  uroporphyrinogen decarboxylase  41.3 
 
 		 354 aa  275  6e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000970328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  41.42 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28976  predicted protein  42.31 
 
 		 365 aa  270  2e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0707495  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0583  uroporphyrinogen decarboxylase  38.64 
 
 		 346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06091  uroporphyrinogen decarboxylase  39.23 
 
 		 346 aa  268  8e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.633731  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  38.17 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  38.94 
 
 		 346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17656  predicted protein  40.18 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0099841  normal  0.0141903 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  43.88 
 
 		 353 aa  262  8e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  41.86 
 
 		 356 aa  256  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18446  predicted protein  38.56 
 
 		 321 aa  251  9.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  38.42 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  36.39 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  38.82 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  39.83 
 
 		 356 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  39.47 
 
 		 355 aa  250  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  38.08 
 
 		 402 aa  250  3e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03630  uroporphyrinogen decarboxylase  37.61 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  39.1 
 
 		 341 aa  248  7e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  39.18 
 
 		 355 aa  248  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  39.43 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  36.68 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  38.42 
 
 		 352 aa  245  9e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  38.18 
 
 		 355 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  38.62 
 
 		 355 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  37.24 
 
 		 380 aa  243  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0946  uroporphyrinogen decarboxylase  37.31 
 
 		 341 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  38.71 
 
 		 353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  38.35 
 
 		 356 aa  242  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  39 
 
 		 340 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  39.54 
 
 		 357 aa  241  9e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  36.47 
 
 		 354 aa  240  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  39.1 
 
 		 352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  45.31 
 
 		 355 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  38.18 
 
 		 359 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  37.54 
 
 		 354 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  38.51 
 
 		 348 aa  239  6.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  35.63 
 
 		 341 aa  238  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  37.54 
 
 		 354 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  41.77 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20757  uroporphyrinogen decarboxylase  38.6 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0771142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  37.83 
 
 		 340 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  40.29 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  38.14 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  41.25 
 
 		 354 aa  236  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  36.05 
 
 		 354 aa  236  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  36.92 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  43.04 
 
 		 360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  36.95 
 
 		 354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  38.99 
 
 		 343 aa  236  6e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3524  uroporphyrinogen decarboxylase  36.95 
 
 		 356 aa  236  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  37.76 
 
 		 354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  41.99 
 
 		 401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  38.35 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  36.07 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  36.47 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  35.48 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  35.26 
 
 		 355 aa  233  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  37.39 
 
 		 364 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  38.76 
 
 		 353 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  41.74 
 
 		 354 aa  233  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3476  uroporphyrinogen decarboxylase  40.06 
 
 		 342 aa  233  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  40.12 
 
 		 354 aa  232  6e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  42.81 
 
 		 345 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  40.12 
 
 		 354 aa  232  6e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  38.18 
 
 		 367 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0134  uroporphyrinogen decarboxylase  36.93 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106114  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  39.06 
 
 		 360 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  39.76 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  38.18 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  38.21 
 
 		 340 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  38.78 
 
 		 351 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  36.66 
 
 		 340 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  35.78 
 
 		 351 aa  229  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  38.24 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  36.95 
 
 		 355 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  35.48 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  36.28 
 
 		 354 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  36.95 
 
 		 355 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  43.29 
 
 		 368 aa  229  4e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  36.95 
 
 		 355 aa  229  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  42.3 
 
 		 361 aa  229  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3342  uroporphyrinogen decarboxylase  38.18 
 
 		 363 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>