More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_10691 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_10691  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 351 aa  723    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.88253  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  84.2 
 
 		 352 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  84.48 
 
 		 352 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18361  uroporphyrinogen decarboxylase  82.76 
 
 		 352 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0918  uroporphyrinogen decarboxylase  82.47 
 
 		 352 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763067  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  84.88 
 
 		 352 aa  613  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  75.07 
 
 		 346 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0583  uroporphyrinogen decarboxylase  74.49 
 
 		 346 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06091  uroporphyrinogen decarboxylase  74.49 
 
 		 346 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.633731  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  74.49 
 
 		 346 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1086  uroporphyrinogen decarboxylase  68.86 
 
 		 354 aa  517  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000970328 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  67.71 
 
 		 353 aa  511  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  71.05 
 
 		 349 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  68.01 
 
 		 354 aa  503  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  67.81 
 
 		 354 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  67.81 
 
 		 354 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  64.94 
 
 		 350 aa  491  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5159  uroporphyrinogen decarboxylase  65.23 
 
 		 350 aa  490  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17656  predicted protein  55.86 
 
 		 339 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0099841  normal  0.0141903 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19188  uroporphyrinogen decarboxylase  55.39 
 
 		 409 aa  402  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28976  predicted protein  50.44 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0707495  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18446  predicted protein  53.73 
 
 		 321 aa  359  3e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20757  uroporphyrinogen decarboxylase  44.74 
 
 		 431 aa  313  3.9999999999999997e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0771142  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  41.47 
 
 		 335 aa  285  8e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  41.81 
 
 		 354 aa  279  5e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  41.76 
 
 		 337 aa  276  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  41.11 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  40.9 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  41.49 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  40.82 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  42.23 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  41.28 
 
 		 355 aa  266  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  38.6 
 
 		 348 aa  265  8.999999999999999e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  41.02 
 
 		 340 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  39 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  38.66 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  41.46 
 
 		 340 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  37.94 
 
 		 353 aa  263  4e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  39.07 
 
 		 348 aa  262  8e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  37.54 
 
 		 342 aa  261  8.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  40.23 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  38.44 
 
 		 360 aa  260  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  37.35 
 
 		 352 aa  259  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 354 aa  259  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  38.19 
 
 		 357 aa  259  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 		 359 aa  259  5.0000000000000005e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  38.39 
 
 		 341 aa  259  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  37.2 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03630  uroporphyrinogen decarboxylase  38.94 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  38.57 
 
 		 380 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  39.7 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  38.69 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  40.77 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 402 aa  256  3e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  43.25 
 
 		 345 aa  256  6e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  40.83 
 
 		 365 aa  255  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  38.82 
 
 		 351 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  38.78 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  39.71 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  39.42 
 
 		 360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  39.19 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  39.42 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  39.42 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  38.71 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  39.71 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 354 aa  253  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  37.01 
 
 		 350 aa  252  7e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  37.09 
 
 		 351 aa  252  7e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  39.66 
 
 		 354 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0946  uroporphyrinogen decarboxylase  36.76 
 
 		 341 aa  251  9.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  37.39 
 
 		 351 aa  251  9.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  38.62 
 
 		 355 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  38.42 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  38.42 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  38.42 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  38.87 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  37.69 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  38.42 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  38.42 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  38.62 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  38.42 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  38.42 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  38.42 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  36.87 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  38.26 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  37.8 
 
 		 352 aa  250  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1599  uroporphyrinogen decarboxylase  37.35 
 
 		 368 aa  250  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586302  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0609  uroporphyrinogen decarboxylase  39 
 
 		 354 aa  250  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884937  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  39.19 
 
 		 351 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  37.69 
 
 		 351 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  38.62 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  39.24 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  39.37 
 
 		 354 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  37.39 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  39.37 
 
 		 354 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02179  uroporphyrinogen decarboxylase  39 
 
 		 354 aa  249  5e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>