More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19188 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_19188  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 409 aa  854    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5159  uroporphyrinogen decarboxylase  54.86 
 
 		 350 aa  419  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  52.99 
 
 		 353 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  54.81 
 
 		 352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  54.05 
 
 		 350 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18361  uroporphyrinogen decarboxylase  54.6 
 
 		 352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1086  uroporphyrinogen decarboxylase  53.43 
 
 		 354 aa  403  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000970328 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10691  uroporphyrinogen decarboxylase  55.39 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.88253  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  51.83 
 
 		 349 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  54.81 
 
 		 352 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  52.89 
 
 		 354 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  52.89 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0918  uroporphyrinogen decarboxylase  54.65 
 
 		 352 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763067  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  52.72 
 
 		 354 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  54.68 
 
 		 352 aa  395  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  52.48 
 
 		 346 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0583  uroporphyrinogen decarboxylase  52.77 
 
 		 346 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06091  uroporphyrinogen decarboxylase  51.6 
 
 		 346 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.633731  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  51.31 
 
 		 346 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17656  predicted protein  50 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0099841  normal  0.0141903 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18446  predicted protein  49.39 
 
 		 321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28976  predicted protein  43.84 
 
 		 365 aa  333  3e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0707495  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  41.33 
 
 		 335 aa  290  4e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20757  uroporphyrinogen decarboxylase  42.09 
 
 		 431 aa  285  9e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0771142  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  39.32 
 
 		 337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  42.29 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  41.83 
 
 		 359 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  41.04 
 
 		 355 aa  263  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  41.55 
 
 		 355 aa  262  8.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  38.48 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  40.75 
 
 		 355 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  37.76 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  39.42 
 
 		 354 aa  260  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  39.33 
 
 		 355 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  40.87 
 
 		 380 aa  258  9e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  38.97 
 
 		 353 aa  257  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  39.54 
 
 		 364 aa  256  5e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  37.33 
 
 		 352 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  42.2 
 
 		 354 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  42.2 
 
 		 354 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  42.2 
 
 		 354 aa  256  6e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  40.12 
 
 		 340 aa  256  7e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  39.88 
 
 		 355 aa  255  8e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  41.91 
 
 		 354 aa  255  8e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  41.62 
 
 		 354 aa  255  8e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  42.2 
 
 		 354 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  41.62 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  41.62 
 
 		 354 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  39.11 
 
 		 352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  42.2 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  38.97 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  39.43 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  40.12 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  42.2 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  40.87 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  41.43 
 
 		 354 aa  253  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  36.36 
 
 		 348 aa  252  7e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  42.49 
 
 		 354 aa  252  7e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  39.48 
 
 		 340 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  42.49 
 
 		 354 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  42.49 
 
 		 354 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  42.49 
 
 		 354 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  38.95 
 
 		 339 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  39.2 
 
 		 354 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  40.58 
 
 		 354 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  40.75 
 
 		 354 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  40.58 
 
 		 354 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  38.57 
 
 		 342 aa  250  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 360 aa  248  9e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  40.87 
 
 		 354 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  40.87 
 
 		 354 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  40.87 
 
 		 354 aa  247  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  40.87 
 
 		 354 aa  247  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  37.39 
 
 		 353 aa  247  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  40.87 
 
 		 354 aa  247  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  40.87 
 
 		 354 aa  247  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  40.87 
 
 		 354 aa  247  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  40.87 
 
 		 354 aa  247  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  40.87 
 
 		 354 aa  247  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 355 aa  246  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  41.45 
 
 		 354 aa  246  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 355 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 357 aa  246  6.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 355 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  37.85 
 
 		 354 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  35.43 
 
 		 402 aa  245  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  37.28 
 
 		 357 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  41.55 
 
 		 365 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  36.68 
 
 		 356 aa  245  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  40.29 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  36.96 
 
 		 361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  39.49 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  40.29 
 
 		 354 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  40.29 
 
 		 354 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  40.29 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  39.1 
 
 		 345 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  39.31 
 
 		 354 aa  244  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0705  uroporphyrinogen decarboxylase  39.6 
 
 		 365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  37.75 
 
 		 345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  38.07 
 
 		 351 aa  243  5e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>