More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6783 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 401 aa  797    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  65.59 
 
 		 345 aa  478  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  66.76 
 
 		 354 aa  473  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  62.86 
 
 		 355 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  64.31 
 
 		 345 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1532  uroporphyrinogen decarboxylase  64.71 
 
 		 371 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.762506  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  63.24 
 
 		 361 aa  450  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1474  uroporphyrinogen decarboxylase  64.55 
 
 		 365 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.000238489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  63.56 
 
 		 345 aa  431  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  63.11 
 
 		 360 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  63.82 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  60.05 
 
 		 369 aa  424  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  60.88 
 
 		 345 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  61.34 
 
 		 353 aa  408  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  62.57 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  59.18 
 
 		 350 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  60.37 
 
 		 354 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1892  uroporphyrinogen decarboxylase  56.7 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15670  uroporphyrinogen decarboxylase  54.74 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.120602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  51.8 
 
 		 340 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2212  uroporphyrinogen decarboxylase  55.95 
 
 		 372 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3435  uroporphyrinogen decarboxylase  58.33 
 
 		 354 aa  371  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000949597  hitchhiker  0.00324968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2201  uroporphyrinogen decarboxylase  56.94 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145725  normal  0.153622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12693  uroporphyrinogen decarboxylase  55.14 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2258  uroporphyrinogen decarboxylase  56.94 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1548  uroporphyrinogen decarboxylase  56.76 
 
 		 372 aa  364  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0412889  normal  0.326148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2481  uroporphyrinogen decarboxylase  57.06 
 
 		 354 aa  362  4e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3919  uroporphyrinogen decarboxylase  55.49 
 
 		 354 aa  360  3e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  0.515897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2772  uroporphyrinogen decarboxylase  56.56 
 
 		 345 aa  360  4e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164918  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2485  uroporphyrinogen decarboxylase  53.57 
 
 		 353 aa  356  2.9999999999999997e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3249  uroporphyrinogen decarboxylase  56.1 
 
 		 378 aa  353  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2494  uroporphyrinogen decarboxylase  55.69 
 
 		 381 aa  352  5e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4010  uroporphyrinogen decarboxylase  54.76 
 
 		 370 aa  350  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36030  uroporphyrinogen decarboxylase  54.71 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.142165  normal  0.921128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  49.26 
 
 		 345 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1585  uroporphyrinogen decarboxylase  56.7 
 
 		 354 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  51.34 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  48.68 
 
 		 360 aa  346  4e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  46.8 
 
 		 345 aa  344  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  48.53 
 
 		 343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15230  uroporphyrinogen decarboxylase  51.19 
 
 		 407 aa  337  2.9999999999999997e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.617606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  46.63 
 
 		 340 aa  335  7e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  45.86 
 
 		 348 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  46.92 
 
 		 340 aa  333  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  45.56 
 
 		 348 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  46.04 
 
 		 340 aa  333  5e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  45.56 
 
 		 348 aa  333  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  45.56 
 
 		 348 aa  333  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  45.56 
 
 		 348 aa  333  5e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  45.56 
 
 		 348 aa  333  5e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  45.56 
 
 		 348 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  45.56 
 
 		 348 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  44.38 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  45.27 
 
 		 348 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  45.27 
 
 		 348 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  45.19 
 
 		 344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26750  uroporphyrinogen decarboxylase  51.04 
 
 		 346 aa  327  3e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.506811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  45.75 
 
 		 339 aa  325  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 345 aa  325  9e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 345 aa  325  9e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  45.45 
 
 		 339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  45.16 
 
 		 339 aa  318  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  45.93 
 
 		 348 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  45.32 
 
 		 352 aa  309  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 351 aa  308  8e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1830  uroporphyrinogen decarboxylase  49.57 
 
 		 356 aa  308  9e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  46.13 
 
 		 356 aa  300  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  45.13 
 
 		 340 aa  295  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  45.67 
 
 		 352 aa  291  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  46.11 
 
 		 354 aa  288  9e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  41.74 
 
 		 355 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  40.92 
 
 		 354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  41.64 
 
 		 347 aa  282  8.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  38.62 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  41.76 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  44.31 
 
 		 356 aa  276  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  41.52 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  41.25 
 
 		 352 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  41.83 
 
 		 353 aa  272  7e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  40.23 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  41.4 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  40.52 
 
 		 355 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  40.41 
 
 		 357 aa  270  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  41.11 
 
 		 354 aa  268  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  41.52 
 
 		 355 aa  268  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  40.52 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  41.52 
 
 		 355 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  41.18 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  41.06 
 
 		 355 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  38.78 
 
 		 352 aa  266  5e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  41.69 
 
 		 365 aa  266  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  40.47 
 
 		 365 aa  265  7e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  41.11 
 
 		 354 aa  266  7e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  40.35 
 
 		 355 aa  265  8e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  40.99 
 
 		 354 aa  265  8e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  40.23 
 
 		 354 aa  265  8e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  40.23 
 
 		 354 aa  265  8e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  40.23 
 
 		 354 aa  265  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  40.52 
 
 		 354 aa  265  8.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  40.52 
 
 		 354 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>