More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1292 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 
356 aa  722    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  69.01 
 
 
348 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  68.33 
 
 
352 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  52.51 
 
 
351 aa  352  4e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  50.29 
 
 
340 aa  349  4e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  50.15 
 
 
340 aa  341  9e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  48.97 
 
 
340 aa  336  5e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  48.68 
 
 
340 aa  333  3e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  53.22 
 
 
354 aa  332  6e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  48.22 
 
 
347 aa  330  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  46.9 
 
 
360 aa  325  7e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  50.6 
 
 
345 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  47.8 
 
 
339 aa  323  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  49.4 
 
 
345 aa  322  5e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  46.65 
 
 
351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  46.2 
 
 
359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  47.23 
 
 
351 aa  317  1e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  45.77 
 
 
351 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  45.48 
 
 
351 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  46.06 
 
 
351 aa  317  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  48.09 
 
 
339 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  48.07 
 
 
343 aa  316  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  47.8 
 
 
339 aa  316  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  49.26 
 
 
345 aa  315  6e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  48.43 
 
 
357 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  46.36 
 
 
351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  45.19 
 
 
351 aa  312  5.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  45.61 
 
 
348 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  48.39 
 
 
340 aa  308  6.999999999999999e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  45.61 
 
 
348 aa  308  8e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  45.61 
 
 
348 aa  308  8e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  45.61 
 
 
348 aa  308  8e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  45.61 
 
 
348 aa  308  8e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  45.09 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  45.75 
 
 
345 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  45.61 
 
 
348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  45.32 
 
 
348 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  45.32 
 
 
348 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  45.32 
 
 
348 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  44.44 
 
 
357 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  46.8 
 
 
350 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  47.52 
 
 
354 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  47.52 
 
 
354 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  46.38 
 
 
356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  43.73 
 
 
355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  43.7 
 
 
344 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  43.4 
 
 
348 aa  302  5.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1532  uroporphyrinogen decarboxylase  47.92 
 
 
371 aa  302  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.762506  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  45.03 
 
 
345 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  43.53 
 
 
354 aa  301  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  46.15 
 
 
368 aa  301  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  47.18 
 
 
361 aa  300  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  45.27 
 
 
360 aa  300  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  45.99 
 
 
369 aa  300  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  47.04 
 
 
345 aa  300  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0112  uroporphyrinogen decarboxylase  46.13 
 
 
392 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  46.13 
 
 
401 aa  300  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  46.36 
 
 
352 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  47.92 
 
 
355 aa  299  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  47.62 
 
 
354 aa  299  5e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  44.44 
 
 
348 aa  299  6e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  46.7 
 
 
364 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  46.7 
 
 
364 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  46.7 
 
 
364 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  46.7 
 
 
364 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  46.7 
 
 
364 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2962  uroporphyrinogen decarboxylase  46.7 
 
 
405 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0170  uroporphyrinogen decarboxylase  46.7 
 
 
405 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  46.7 
 
 
364 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  45.85 
 
 
366 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  45.48 
 
 
354 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3890  uroporphyrinogen decarboxylase  45.85 
 
 
366 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  45.29 
 
 
354 aa  296  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3023  uroporphyrinogen decarboxylase  45.56 
 
 
378 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0126  uroporphyrinogen decarboxylase  45.27 
 
 
375 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3039  uroporphyrinogen decarboxylase  47.7 
 
 
360 aa  296  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1474  uroporphyrinogen decarboxylase  47.62 
 
 
365 aa  296  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.000238489 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  43.64 
 
 
365 aa  296  5e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  45.48 
 
 
354 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  46.38 
 
 
356 aa  295  6e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  45.48 
 
 
354 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  45.48 
 
 
354 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3292  uroporphyrinogen decarboxylase  45.27 
 
 
392 aa  295  9e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.136246  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  45.96 
 
 
367 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  43.11 
 
 
345 aa  295  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  43.11 
 
 
345 aa  295  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  44.29 
 
 
361 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3524  uroporphyrinogen decarboxylase  46.06 
 
 
356 aa  293  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  46.24 
 
 
367 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  43.4 
 
 
380 aa  294  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  46.76 
 
 
356 aa  294  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 
355 aa  293  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  46.27 
 
 
355 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  44.29 
 
 
402 aa  293  4e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2944  uroporphyrinogen decarboxylase  44.7 
 
 
392 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0032555  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0111  uroporphyrinogen decarboxylase  44.7 
 
 
392 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0979299  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 
354 aa  292  6e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  43.06 
 
 
354 aa  291  8e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0110  uroporphyrinogen decarboxylase  44.99 
 
 
375 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  44.99 
 
 
392 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>