More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1403 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 
352 aa  705    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  75.64 
 
 
356 aa  537  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  46.43 
 
 
340 aa  329  4e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  46.88 
 
 
340 aa  329  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  46.59 
 
 
340 aa  328  7e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  45.67 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  43.75 
 
 
339 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  47.02 
 
 
343 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  43.75 
 
 
339 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  47.09 
 
 
345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  46.82 
 
 
345 aa  300  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  47.76 
 
 
345 aa  299  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  45.19 
 
 
345 aa  298  7e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  45.05 
 
 
360 aa  296  5e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  44.96 
 
 
360 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  46.61 
 
 
354 aa  293  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  46.13 
 
 
345 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  47.37 
 
 
361 aa  291  8e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  45.67 
 
 
401 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  45.24 
 
 
345 aa  290  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  44.64 
 
 
340 aa  290  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  45.61 
 
 
357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  44.16 
 
 
365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  46.86 
 
 
365 aa  282  8.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  44.54 
 
 
356 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 
350 aa  280  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  46.63 
 
 
353 aa  280  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  45.22 
 
 
348 aa  279  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  44.93 
 
 
369 aa  278  7e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  43.24 
 
 
342 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  45.19 
 
 
354 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0566  uroporphyrinogen decarboxylase  43.77 
 
 
370 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  41.25 
 
 
357 aa  276  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0821  uroporphyrinogen decarboxylase  42.47 
 
 
369 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00198157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  43.99 
 
 
339 aa  276  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  44.31 
 
 
355 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  44.05 
 
 
340 aa  276  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1474  uroporphyrinogen decarboxylase  46.11 
 
 
365 aa  276  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.000238489 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  40.94 
 
 
348 aa  275  7e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  45.29 
 
 
351 aa  275  7e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  40.94 
 
 
348 aa  275  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  40.94 
 
 
348 aa  275  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  40.94 
 
 
348 aa  275  8e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  40.94 
 
 
348 aa  275  8e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  40.94 
 
 
348 aa  275  9e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  40.94 
 
 
348 aa  275  9e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  44.6 
 
 
352 aa  275  9e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4469  uroporphyrinogen decarboxylase  44.54 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.450699  normal  0.0158572 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  45.22 
 
 
352 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  40.94 
 
 
348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  40.94 
 
 
348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  44.76 
 
 
364 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  44.76 
 
 
364 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  44.76 
 
 
364 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  44.76 
 
 
364 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  45.69 
 
 
402 aa  271  9e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  44.76 
 
 
364 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3861  uroporphyrinogen decarboxylase  43.14 
 
 
370 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0010  uroporphyrinogen decarboxylase  43.49 
 
 
370 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717373  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2962  uroporphyrinogen decarboxylase  44.76 
 
 
405 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0170  uroporphyrinogen decarboxylase  45.24 
 
 
405 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 
364 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3134  uroporphyrinogen decarboxylase  43.14 
 
 
370 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1532  uroporphyrinogen decarboxylase  45.38 
 
 
371 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.762506  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  45.4 
 
 
361 aa  270  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  40.64 
 
 
348 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  42.54 
 
 
356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  45.51 
 
 
353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 
354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  40.69 
 
 
354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  41.31 
 
 
359 aa  269  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  43.66 
 
 
356 aa  270  4e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0727  uroporphyrinogen decarboxylase  43.98 
 
 
370 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  41.03 
 
 
355 aa  269  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0363  uroporphyrinogen decarboxylase  43.54 
 
 
369 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178148  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  40.17 
 
 
355 aa  268  7e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  41.03 
 
 
355 aa  268  8e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  44.87 
 
 
359 aa  268  8.999999999999999e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15670  uroporphyrinogen decarboxylase  44.84 
 
 
369 aa  268  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.120602  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3292  uroporphyrinogen decarboxylase  43.8 
 
 
392 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.136246  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  41.89 
 
 
341 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4264  uroporphyrinogen decarboxylase  44.1 
 
 
369 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3342  uroporphyrinogen decarboxylase  43.7 
 
 
363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  44.51 
 
 
355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  40.7 
 
 
351 aa  266  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0126  uroporphyrinogen decarboxylase  43.8 
 
 
375 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  41.55 
 
 
354 aa  266  5e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0112  uroporphyrinogen decarboxylase  43.06 
 
 
392 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  42.44 
 
 
352 aa  265  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  42.27 
 
 
355 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  42.4 
 
 
350 aa  265  8e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  44.38 
 
 
366 aa  265  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3023  uroporphyrinogen decarboxylase  43.8 
 
 
378 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2944  uroporphyrinogen decarboxylase  43.52 
 
 
392 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0032555  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0111  uroporphyrinogen decarboxylase  43.52 
 
 
392 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0979299  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  40.18 
 
 
344 aa  264  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  39.53 
 
 
351 aa  263  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3524  uroporphyrinogen decarboxylase  45.51 
 
 
356 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  42.27 
 
 
355 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  42.27 
 
 
355 aa  263  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>