More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0918 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0918  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 352 aa  723    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763067  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  92.02 
 
 		 352 aa  676    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18361  uroporphyrinogen decarboxylase  85.23 
 
 		 352 aa  630  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  82.76 
 
 		 352 aa  611  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10691  uroporphyrinogen decarboxylase  82.47 
 
 		 351 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.88253  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  82.76 
 
 		 352 aa  610  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0583  uroporphyrinogen decarboxylase  74.13 
 
 		 346 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  74.13 
 
 		 346 aa  554  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  74.42 
 
 		 346 aa  551  1e-156  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06091  uroporphyrinogen decarboxylase  73.84 
 
 		 346 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.633731  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  69.88 
 
 		 349 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  68.71 
 
 		 353 aa  501  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  67.94 
 
 		 354 aa  496  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1086  uroporphyrinogen decarboxylase  68.51 
 
 		 354 aa  492  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000970328 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5159  uroporphyrinogen decarboxylase  66.86 
 
 		 350 aa  491  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  65.7 
 
 		 350 aa  482  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  66.96 
 
 		 354 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  66.96 
 
 		 354 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17656  predicted protein  57.06 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0099841  normal  0.0141903 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19188  uroporphyrinogen decarboxylase  54.65 
 
 		 409 aa  399  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28976  predicted protein  50.15 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0707495  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18446  predicted protein  55.14 
 
 		 321 aa  358  6e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20757  uroporphyrinogen decarboxylase  44.88 
 
 		 431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0771142  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  42.48 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  41.37 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  42.65 
 
 		 337 aa  273  5.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  41.57 
 
 		 354 aa  272  6e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  40.37 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  41.09 
 
 		 351 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  39.6 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  40.55 
 
 		 340 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 		 340 aa  262  6e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  40.86 
 
 		 354 aa  262  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  40.36 
 
 		 351 aa  262  6e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  39.58 
 
 		 351 aa  262  6.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  39.58 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 		 360 aa  260  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  38.18 
 
 		 353 aa  259  4e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  39.27 
 
 		 351 aa  259  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  39.58 
 
 		 351 aa  259  4e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  37.91 
 
 		 352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  39.46 
 
 		 355 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  39.17 
 
 		 341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  40.96 
 
 		 353 aa  259  6e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  39.16 
 
 		 351 aa  258  9e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  38.39 
 
 		 354 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  41.8 
 
 		 345 aa  256  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  39.47 
 
 		 355 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  39.29 
 
 		 354 aa  256  6e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  39.34 
 
 		 351 aa  255  8e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  38.14 
 
 		 357 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  38.99 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0705  uroporphyrinogen decarboxylase  38.37 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  38.69 
 
 		 354 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  38.39 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  38.87 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03630  uroporphyrinogen decarboxylase  37.57 
 
 		 343 aa  253  5.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  36.61 
 
 		 364 aa  252  6e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  37.8 
 
 		 354 aa  252  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  38.39 
 
 		 355 aa  252  8.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  39.17 
 
 		 355 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  39.33 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  39.1 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  36.31 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  37.65 
 
 		 350 aa  251  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  39.1 
 
 		 354 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  39.1 
 
 		 354 aa  250  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  37.69 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 360 aa  249  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  39.02 
 
 		 340 aa  249  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  37.61 
 
 		 340 aa  249  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  39.17 
 
 		 355 aa  249  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 		 354 aa  249  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  36.34 
 
 		 354 aa  249  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0609  uroporphyrinogen decarboxylase  39.08 
 
 		 354 aa  249  5e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884937  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  37.84 
 
 		 361 aa  248  8e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  39.1 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  37.84 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  37.91 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  38.79 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  38.46 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0689  uroporphyrinogen decarboxylase  38.79 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  37.91 
 
 		 354 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  36.39 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  37.91 
 
 		 380 aa  247  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  37.5 
 
 		 354 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  39.1 
 
 		 352 aa  247  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  38.69 
 
 		 354 aa  246  3e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  38.51 
 
 		 354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  39.88 
 
 		 360 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  38.14 
 
 		 355 aa  246  6e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  37.8 
 
 		 355 aa  245  6.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  38.91 
 
 		 356 aa  245  8e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  36.9 
 
 		 354 aa  245  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  37.2 
 
 		 354 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  37.99 
 
 		 343 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  38.64 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  38.72 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1118  uroporphyrinogen decarboxylase  39.88 
 
 		 366 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  38.64 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>