More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20757 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_20757  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 431 aa  900    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0771142  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28976  predicted protein  51.46 
 
 		 365 aa  355  6.999999999999999e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0707495  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  48.97 
 
 		 353 aa  339  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  48.83 
 
 		 354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  48.83 
 
 		 354 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  48.86 
 
 		 349 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  48.39 
 
 		 354 aa  334  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5159  uroporphyrinogen decarboxylase  49.12 
 
 		 350 aa  326  4.0000000000000003e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  48.28 
 
 		 350 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1086  uroporphyrinogen decarboxylase  46.92 
 
 		 354 aa  325  1e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000970328 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10691  uroporphyrinogen decarboxylase  45.37 
 
 		 351 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.88253  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  45.48 
 
 		 352 aa  313  2.9999999999999996e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18361  uroporphyrinogen decarboxylase  45.32 
 
 		 352 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  43.58 
 
 		 352 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  43.88 
 
 		 352 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0918  uroporphyrinogen decarboxylase  44.88 
 
 		 352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763067  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06091  uroporphyrinogen decarboxylase  41.69 
 
 		 346 aa  293  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.633731  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19188  uroporphyrinogen decarboxylase  38.79 
 
 		 409 aa  291  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  40.92 
 
 		 346 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17656  predicted protein  43.6 
 
 		 339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0099841  normal  0.0141903 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0583  uroporphyrinogen decarboxylase  41.11 
 
 		 346 aa  289  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  40.82 
 
 		 346 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18446  predicted protein  43.56 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  38.19 
 
 		 348 aa  262  6.999999999999999e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  40.64 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  39.71 
 
 		 337 aa  246  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  39.47 
 
 		 339 aa  246  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  39.35 
 
 		 340 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  39.18 
 
 		 339 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  39.18 
 
 		 339 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  39.47 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  38.6 
 
 		 335 aa  238  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  34.29 
 
 		 351 aa  236  6e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  38.79 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  38.58 
 
 		 401 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  37.11 
 
 		 348 aa  230  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  36.72 
 
 		 356 aa  229  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  36.28 
 
 		 340 aa  230  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  39.64 
 
 		 340 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  39.42 
 
 		 354 aa  226  7e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  36.49 
 
 		 353 aa  226  8e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  34.48 
 
 		 344 aa  226  9e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  38.35 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3342  uroporphyrinogen decarboxylase  37.25 
 
 		 363 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3023  uroporphyrinogen decarboxylase  36.47 
 
 		 378 aa  223  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  32.75 
 
 		 351 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  33.91 
 
 		 351 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  35.65 
 
 		 345 aa  219  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  36.21 
 
 		 354 aa  219  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  32.75 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  36.55 
 
 		 345 aa  219  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  33.04 
 
 		 351 aa  217  4e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  34.8 
 
 		 364 aa  217  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  32.75 
 
 		 351 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  34.48 
 
 		 352 aa  216  7e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3890  uroporphyrinogen decarboxylase  35.61 
 
 		 366 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  34.1 
 
 		 351 aa  216  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1599  uroporphyrinogen decarboxylase  34.51 
 
 		 368 aa  216  9e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586302  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  36.39 
 
 		 350 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  37.78 
 
 		 353 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  32.57 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  35.33 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3491  uroporphyrinogen decarboxylase  36.94 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000153179  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  33.14 
 
 		 352 aa  214  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  35.17 
 
 		 352 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  36.84 
 
 		 367 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  33.52 
 
 		 353 aa  213  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  37.12 
 
 		 367 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03630  uroporphyrinogen decarboxylase  35.03 
 
 		 343 aa  212  9e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  33.63 
 
 		 360 aa  212  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  35.61 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  35.61 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2962  uroporphyrinogen decarboxylase  35.61 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15670  uroporphyrinogen decarboxylase  37.65 
 
 		 369 aa  211  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.120602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0112  uroporphyrinogen decarboxylase  35.61 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0170  uroporphyrinogen decarboxylase  35.61 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  35.61 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  35.61 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  37.25 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  35.61 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1200  uroporphyrinogen decarboxylase  35.55 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0134  uroporphyrinogen decarboxylase  35.73 
 
 		 372 aa  210  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106114  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  35.61 
 
 		 364 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  35.57 
 
 		 361 aa  210  4e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  32.75 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  32.75 
 
 		 345 aa  209  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  35.57 
 
 		 402 aa  209  6e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  35.84 
 
 		 354 aa  209  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3435  uroporphyrinogen decarboxylase  36.89 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000949597  hitchhiker  0.00324968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  35.07 
 
 		 345 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  36.89 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3303  uroporphyrinogen decarboxylase  36.74 
 
 		 364 aa  207  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0163615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  34.2 
 
 		 342 aa  207  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  34.57 
 
 		 354 aa  207  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1502  uroporphyrinogen decarboxylase  32.53 
 
 		 378 aa  206  5e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  37.89 
 
 		 353 aa  206  6e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  34.72 
 
 		 354 aa  206  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0126  uroporphyrinogen decarboxylase  35.06 
 
 		 375 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  33.33 
 
 		 352 aa  206  7e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  33.43 
 
 		 345 aa  206  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>