More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0619 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 340 aa  698    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  80.59 
 
 		 340 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  81.18 
 
 		 340 aa  580  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  80.53 
 
 		 340 aa  580  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  79.71 
 
 		 339 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  77.94 
 
 		 339 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  77.65 
 
 		 339 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  65.18 
 
 		 343 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  47.65 
 
 		 340 aa  337  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  50.73 
 
 		 354 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  50.73 
 
 		 354 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  48.84 
 
 		 359 aa  335  7e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  49.28 
 
 		 365 aa  334  1e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  51.16 
 
 		 357 aa  333  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  47.66 
 
 		 360 aa  333  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  47.67 
 
 		 354 aa  333  4e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  50.58 
 
 		 354 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  50.58 
 
 		 354 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  50.58 
 
 		 354 aa  332  7.000000000000001e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  50.58 
 
 		 354 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  50.58 
 
 		 354 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  50.58 
 
 		 354 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  50.58 
 
 		 354 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  50.58 
 
 		 354 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  50.58 
 
 		 354 aa  332  8e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  46.82 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  48.55 
 
 		 352 aa  331  1e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  48.41 
 
 		 380 aa  331  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 		 354 aa  329  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  48.39 
 
 		 356 aa  328  8e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  51.16 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  50.29 
 
 		 354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  52.49 
 
 		 354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  48.84 
 
 		 354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  50.29 
 
 		 354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  49.57 
 
 		 355 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  49.57 
 
 		 355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  49.57 
 
 		 355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  47.4 
 
 		 355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 		 354 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  49.42 
 
 		 354 aa  325  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  50.29 
 
 		 354 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 		 354 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0112  uroporphyrinogen decarboxylase  49.15 
 
 		 392 aa  324  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  49.28 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  47.67 
 
 		 355 aa  324  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  48.84 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  47.55 
 
 		 355 aa  322  5e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  47.38 
 
 		 348 aa  322  6e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  46.69 
 
 		 355 aa  321  9.000000000000001e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  49.55 
 
 		 359 aa  321  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  49.28 
 
 		 354 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  49.86 
 
 		 355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  49.13 
 
 		 354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  48.7 
 
 		 355 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3342  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 		 363 aa  319  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3890  uroporphyrinogen decarboxylase  48.86 
 
 		 366 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  49.57 
 
 		 355 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  46.51 
 
 		 354 aa  320  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  49.57 
 
 		 355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  49.71 
 
 		 360 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  45.29 
 
 		 351 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  48.55 
 
 		 354 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  48.3 
 
 		 366 aa  318  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  47.63 
 
 		 340 aa  318  9e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  48.55 
 
 		 354 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  48.26 
 
 		 354 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2944  uroporphyrinogen decarboxylase  48.58 
 
 		 392 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0032555  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0111  uroporphyrinogen decarboxylase  48.58 
 
 		 392 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0979299  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  48.84 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3292  uroporphyrinogen decarboxylase  48.3 
 
 		 392 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.136246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  48.26 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  45.7 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  48.08 
 
 		 345 aa  316  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  47.4 
 
 		 354 aa  315  6e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  49.29 
 
 		 367 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  50.29 
 
 		 365 aa  315  7e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  49.29 
 
 		 367 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  48.3 
 
 		 364 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  48.3 
 
 		 364 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  48.3 
 
 		 364 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  49.28 
 
 		 355 aa  314  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  48.3 
 
 		 364 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  48.3 
 
 		 392 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  48.3 
 
 		 364 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0110  uroporphyrinogen decarboxylase  48.3 
 
 		 375 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3023  uroporphyrinogen decarboxylase  48.3 
 
 		 378 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  48.3 
 
 		 364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0126  uroporphyrinogen decarboxylase  48.01 
 
 		 375 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  47.38 
 
 		 353 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  48.27 
 
 		 354 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2962  uroporphyrinogen decarboxylase  48.3 
 
 		 405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0170  uroporphyrinogen decarboxylase  48.3 
 
 		 405 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  46.13 
 
 		 347 aa  313  2.9999999999999996e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  45.93 
 
 		 351 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  47.66 
 
 		 351 aa  312  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  46.8 
 
 		 402 aa  312  4.999999999999999e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 		 348 aa  312  4.999999999999999e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  46.8 
 
 		 361 aa  312  4.999999999999999e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  46.22 
 
 		 351 aa  312  6.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>