More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3674 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 345 aa  686    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  66.57 
 
 		 354 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  64.33 
 
 		 345 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  65.68 
 
 		 345 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  63.2 
 
 		 361 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  64.99 
 
 		 345 aa  442  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  63.39 
 
 		 355 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  63.56 
 
 		 401 aa  431  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1532  uroporphyrinogen decarboxylase  63.88 
 
 		 371 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.762506  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  62.57 
 
 		 355 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1474  uroporphyrinogen decarboxylase  63.88 
 
 		 365 aa  408  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.000238489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  61.88 
 
 		 353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15670  uroporphyrinogen decarboxylase  62.95 
 
 		 369 aa  403  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.120602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  60.82 
 
 		 350 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  60.24 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  60.18 
 
 		 369 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  57.95 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  60.24 
 
 		 368 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1548  uroporphyrinogen decarboxylase  58.77 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0412889  normal  0.326148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1892  uroporphyrinogen decarboxylase  57.94 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2212  uroporphyrinogen decarboxylase  56.21 
 
 		 372 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2201  uroporphyrinogen decarboxylase  56.21 
 
 		 354 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145725  normal  0.153622 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2258  uroporphyrinogen decarboxylase  56.21 
 
 		 354 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2485  uroporphyrinogen decarboxylase  54.76 
 
 		 353 aa  356  2.9999999999999997e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  52.55 
 
 		 340 aa  355  5e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12693  uroporphyrinogen decarboxylase  54.62 
 
 		 357 aa  352  4e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36030  uroporphyrinogen decarboxylase  55.52 
 
 		 355 aa  352  4e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.142165  normal  0.921128 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3435  uroporphyrinogen decarboxylase  54.52 
 
 		 354 aa  347  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000949597  hitchhiker  0.00324968 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2772  uroporphyrinogen decarboxylase  57.06 
 
 		 345 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164918  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26750  uroporphyrinogen decarboxylase  54.87 
 
 		 346 aa  346  4e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.506811  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3919  uroporphyrinogen decarboxylase  54.55 
 
 		 354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  0.515897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2481  uroporphyrinogen decarboxylase  55.72 
 
 		 354 aa  343  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2494  uroporphyrinogen decarboxylase  56.47 
 
 		 381 aa  342  8e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  46.92 
 
 		 348 aa  339  4e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  46.92 
 
 		 348 aa  339  4e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  46.92 
 
 		 348 aa  339  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  46.92 
 
 		 348 aa  339  4e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  46.92 
 
 		 348 aa  339  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  46.92 
 
 		 348 aa  339  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  46.92 
 
 		 348 aa  339  5e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1585  uroporphyrinogen decarboxylase  54 
 
 		 354 aa  338  8e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  47.2 
 
 		 345 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  46.92 
 
 		 348 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  46.63 
 
 		 348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  47.21 
 
 		 348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3249  uroporphyrinogen decarboxylase  54.6 
 
 		 378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  47.79 
 
 		 345 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  44.87 
 
 		 357 aa  330  3e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4010  uroporphyrinogen decarboxylase  54.91 
 
 		 370 aa  328  8e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  47.09 
 
 		 360 aa  325  5e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15230  uroporphyrinogen decarboxylase  51.28 
 
 		 407 aa  321  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.617606  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  44.12 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  48.07 
 
 		 359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  44.12 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  43.82 
 
 		 344 aa  320  3e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  49.26 
 
 		 356 aa  315  5e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  45.83 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  45.24 
 
 		 339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  45.29 
 
 		 339 aa  309  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  45.29 
 
 		 339 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  46.13 
 
 		 340 aa  306  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  46.13 
 
 		 340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  47.02 
 
 		 343 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  47.25 
 
 		 348 aa  300  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  47.06 
 
 		 352 aa  296  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  44.97 
 
 		 347 aa  294  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1830  uroporphyrinogen decarboxylase  48.39 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  45.24 
 
 		 352 aa  290  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  45.53 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  46.63 
 
 		 340 aa  287  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  41.42 
 
 		 351 aa  286  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  47.95 
 
 		 354 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  38.87 
 
 		 348 aa  276  3e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  41.25 
 
 		 340 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  40.99 
 
 		 351 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  40.51 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  41.79 
 
 		 352 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  41.28 
 
 		 351 aa  266  4e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  40.99 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  44.02 
 
 		 357 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  40.99 
 
 		 351 aa  262  8e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  42.22 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  40.12 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  40.41 
 
 		 351 aa  260  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  41.62 
 
 		 361 aa  259  6e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  40.99 
 
 		 351 aa  259  6e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  41.62 
 
 		 402 aa  258  8e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  43.84 
 
 		 355 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 353 aa  256  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  43.84 
 
 		 355 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  39.71 
 
 		 355 aa  255  8e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  42.64 
 
 		 354 aa  255  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  42.39 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  40.35 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  41.47 
 
 		 350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1147  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 		 350 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1118  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  42.73 
 
 		 351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1216  uroporphyrinogen decarboxylase  42.65 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>