More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36030 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36030  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 355 aa  699    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.142165  normal  0.921128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3249  uroporphyrinogen decarboxylase  75.91 
 
 		 378 aa  525  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2485  uroporphyrinogen decarboxylase  74.5 
 
 		 353 aa  518  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2494  uroporphyrinogen decarboxylase  73.3 
 
 		 381 aa  485  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3435  uroporphyrinogen decarboxylase  70.62 
 
 		 354 aa  483  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000949597  hitchhiker  0.00324968 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2772  uroporphyrinogen decarboxylase  74.93 
 
 		 345 aa  482  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164918  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15230  uroporphyrinogen decarboxylase  67.39 
 
 		 407 aa  458  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.617606  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4010  uroporphyrinogen decarboxylase  68.7 
 
 		 370 aa  432  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1548  uroporphyrinogen decarboxylase  65.62 
 
 		 372 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0412889  normal  0.326148 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26750  uroporphyrinogen decarboxylase  61.72 
 
 		 346 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.506811  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  59.24 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1532  uroporphyrinogen decarboxylase  58.7 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.762506  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  57.43 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1474  uroporphyrinogen decarboxylase  58.46 
 
 		 365 aa  360  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.000238489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  55.78 
 
 		 360 aa  358  6e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  59.35 
 
 		 355 aa  358  9e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  54.25 
 
 		 354 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  56.32 
 
 		 368 aa  355  5e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1585  uroporphyrinogen decarboxylase  59.29 
 
 		 354 aa  353  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  55.52 
 
 		 345 aa  352  5e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  56.6 
 
 		 369 aa  351  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  54.71 
 
 		 401 aa  350  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  55.43 
 
 		 345 aa  348  9e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1892  uroporphyrinogen decarboxylase  55.08 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  55.3 
 
 		 354 aa  342  7e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15670  uroporphyrinogen decarboxylase  57.1 
 
 		 369 aa  341  1e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.120602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  53.1 
 
 		 361 aa  340  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  52.38 
 
 		 355 aa  335  7e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  51.94 
 
 		 345 aa  335  9e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12693  uroporphyrinogen decarboxylase  53.41 
 
 		 357 aa  335  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  52.21 
 
 		 345 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2201  uroporphyrinogen decarboxylase  53.89 
 
 		 354 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145725  normal  0.153622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2212  uroporphyrinogen decarboxylase  53.89 
 
 		 372 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2258  uroporphyrinogen decarboxylase  53.89 
 
 		 354 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2481  uroporphyrinogen decarboxylase  53.16 
 
 		 354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  47.62 
 
 		 340 aa  311  7.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3919  uroporphyrinogen decarboxylase  52.01 
 
 		 354 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  0.515897 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  41.76 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  41.76 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  41.76 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  41.76 
 
 		 348 aa  300  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  41.76 
 
 		 348 aa  300  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  41.76 
 
 		 348 aa  300  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  41.76 
 
 		 348 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  41.76 
 
 		 348 aa  299  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  41.76 
 
 		 348 aa  298  7e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  41.76 
 
 		 348 aa  298  9e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  41.18 
 
 		 357 aa  296  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  41.3 
 
 		 345 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  45.01 
 
 		 360 aa  285  7e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  46.87 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  38.86 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 		 345 aa  279  6e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 		 345 aa  279  6e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  40.29 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1830  uroporphyrinogen decarboxylase  46.43 
 
 		 356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  41.67 
 
 		 340 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 		 340 aa  259  7e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  43.62 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  41.84 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  41.84 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  38.76 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  42.14 
 
 		 340 aa  255  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  40.92 
 
 		 348 aa  251  9.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  41.59 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  40.24 
 
 		 339 aa  248  9e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  40.52 
 
 		 352 aa  247  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  42.04 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  39.71 
 
 		 356 aa  239  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  39.69 
 
 		 341 aa  225  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  40.47 
 
 		 354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  40.47 
 
 		 354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  39.89 
 
 		 361 aa  223  6e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  36.47 
 
 		 364 aa  223  6e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  39.89 
 
 		 402 aa  222  7e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  39.42 
 
 		 354 aa  222  9e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03630  uroporphyrinogen decarboxylase  37.5 
 
 		 343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  37.94 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  36.86 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  37.8 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  39.07 
 
 		 351 aa  218  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  38 
 
 		 356 aa  217  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  37.79 
 
 		 354 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  38.08 
 
 		 354 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  38.66 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  38.19 
 
 		 351 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  37.24 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  37.35 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  38.95 
 
 		 355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  39.53 
 
 		 352 aa  212  7.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  41.94 
 
 		 354 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  33.53 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  37.65 
 
 		 351 aa  210  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  37.06 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0946  uroporphyrinogen decarboxylase  38.63 
 
 		 341 aa  209  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  40.88 
 
 		 353 aa  210  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  39.13 
 
 		 357 aa  210  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  36.44 
 
 		 354 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 		 335 aa  209  9e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  37.03 
 
 		 351 aa  208  9e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>