More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2481 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2481  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 354 aa  697    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3919  uroporphyrinogen decarboxylase  89.27 
 
 		 354 aa  608  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  0.515897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2201  uroporphyrinogen decarboxylase  84.75 
 
 		 354 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145725  normal  0.153622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2212  uroporphyrinogen decarboxylase  84.75 
 
 		 372 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2258  uroporphyrinogen decarboxylase  84.75 
 
 		 354 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12693  uroporphyrinogen decarboxylase  77.03 
 
 		 357 aa  543  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  63.48 
 
 		 354 aa  425  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1892  uroporphyrinogen decarboxylase  65.71 
 
 		 357 aa  414  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  62.89 
 
 		 350 aa  415  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  59.1 
 
 		 353 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  60.29 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1532  uroporphyrinogen decarboxylase  61.56 
 
 		 371 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.762506  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  57.93 
 
 		 355 aa  388  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  57.93 
 
 		 345 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  60.93 
 
 		 369 aa  383  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  60.98 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1474  uroporphyrinogen decarboxylase  60.98 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.000238489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  57.06 
 
 		 401 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  56.9 
 
 		 345 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  57.51 
 
 		 361 aa  368  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  58.36 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  55.97 
 
 		 345 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  60.06 
 
 		 368 aa  361  9e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3435  uroporphyrinogen decarboxylase  57.02 
 
 		 354 aa  357  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000949597  hitchhiker  0.00324968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  55.72 
 
 		 345 aa  349  3e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3249  uroporphyrinogen decarboxylase  54.89 
 
 		 378 aa  342  5.999999999999999e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1548  uroporphyrinogen decarboxylase  55.81 
 
 		 372 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0412889  normal  0.326148 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15670  uroporphyrinogen decarboxylase  56.27 
 
 		 369 aa  339  5e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.120602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36030  uroporphyrinogen decarboxylase  53.16 
 
 		 355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.142165  normal  0.921128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4010  uroporphyrinogen decarboxylase  54.89 
 
 		 370 aa  326  4.0000000000000003e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2772  uroporphyrinogen decarboxylase  51.73 
 
 		 345 aa  324  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2494  uroporphyrinogen decarboxylase  51.73 
 
 		 381 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2485  uroporphyrinogen decarboxylase  52.99 
 
 		 353 aa  319  5e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15230  uroporphyrinogen decarboxylase  51.67 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.617606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  49.4 
 
 		 340 aa  308  8e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1585  uroporphyrinogen decarboxylase  51.83 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  45.64 
 
 		 345 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  45.48 
 
 		 345 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  43.43 
 
 		 357 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  43.9 
 
 		 348 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 348 aa  298  7e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 348 aa  298  8e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 348 aa  298  8e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 348 aa  298  8e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 348 aa  298  8e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 348 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26750  uroporphyrinogen decarboxylase  50.91 
 
 		 346 aa  297  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.506811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 		 348 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 		 348 aa  296  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 		 348 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  47.76 
 
 		 359 aa  296  5e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  46.4 
 
 		 360 aa  294  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  42.11 
 
 		 345 aa  288  8e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  42.11 
 
 		 345 aa  288  8e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  47.54 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  41.98 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1830  uroporphyrinogen decarboxylase  48.55 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  43.94 
 
 		 348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  44.66 
 
 		 340 aa  266  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  44.1 
 
 		 339 aa  265  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  44.1 
 
 		 339 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  43.82 
 
 		 340 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  43.54 
 
 		 340 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  43.43 
 
 		 347 aa  261  8.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 339 aa  258  8e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  41.81 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  43.27 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  40.57 
 
 		 351 aa  256  5e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  43.73 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  45.43 
 
 		 340 aa  249  7e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  40.17 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  40.06 
 
 		 340 aa  242  7.999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  39.89 
 
 		 355 aa  239  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  42.27 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  40.95 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  40.73 
 
 		 354 aa  236  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  41.93 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  40.73 
 
 		 354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  42.15 
 
 		 353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  41.01 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  33.04 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  40.45 
 
 		 354 aa  233  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  41.69 
 
 		 354 aa  233  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  41.57 
 
 		 354 aa  232  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  40.9 
 
 		 354 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  40.12 
 
 		 364 aa  232  8.000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  41.5 
 
 		 354 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  40.4 
 
 		 354 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  39.89 
 
 		 354 aa  229  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  40.45 
 
 		 355 aa  229  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17656  predicted protein  40.06 
 
 		 339 aa  229  7e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0099841  normal  0.0141903 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  40.11 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  40.73 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  40.34 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  39.55 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  40.56 
 
 		 354 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  43.19 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  40.9 
 
 		 354 aa  227  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  40.56 
 
 		 354 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>