More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26750 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_26750  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 346 aa  684    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.506811  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36030  uroporphyrinogen decarboxylase  61.72 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.142165  normal  0.921128 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2485  uroporphyrinogen decarboxylase  58.75 
 
 		 353 aa  381  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2494  uroporphyrinogen decarboxylase  61.06 
 
 		 381 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3249  uroporphyrinogen decarboxylase  60.12 
 
 		 378 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1548  uroporphyrinogen decarboxylase  60.29 
 
 		 372 aa  378  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0412889  normal  0.326148 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15230  uroporphyrinogen decarboxylase  60 
 
 		 407 aa  374  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.617606  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2772  uroporphyrinogen decarboxylase  60.18 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164918  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3435  uroporphyrinogen decarboxylase  56.8 
 
 		 354 aa  358  5e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000949597  hitchhiker  0.00324968 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4010  uroporphyrinogen decarboxylase  57.39 
 
 		 370 aa  348  8e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  55.19 
 
 		 355 aa  346  4e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  54.87 
 
 		 345 aa  346  4e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  54.34 
 
 		 350 aa  342  5e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  54.07 
 
 		 353 aa  342  5e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  53.22 
 
 		 361 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  53.98 
 
 		 368 aa  332  4e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1585  uroporphyrinogen decarboxylase  57.23 
 
 		 354 aa  332  5e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1532  uroporphyrinogen decarboxylase  54.73 
 
 		 371 aa  332  7.000000000000001e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.762506  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  51.31 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  50.15 
 
 		 345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  51.04 
 
 		 401 aa  327  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  52.65 
 
 		 360 aa  325  7e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  52.44 
 
 		 354 aa  324  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15670  uroporphyrinogen decarboxylase  52.21 
 
 		 369 aa  322  6e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.120602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1474  uroporphyrinogen decarboxylase  53.85 
 
 		 365 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.000238489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  53.27 
 
 		 369 aa  318  7.999999999999999e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  52.51 
 
 		 345 aa  318  7.999999999999999e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  51.59 
 
 		 354 aa  315  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 		 345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2212  uroporphyrinogen decarboxylase  48.86 
 
 		 372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2201  uroporphyrinogen decarboxylase  48.86 
 
 		 354 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145725  normal  0.153622 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1892  uroporphyrinogen decarboxylase  52.58 
 
 		 357 aa  306  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2258  uroporphyrinogen decarboxylase  48.86 
 
 		 354 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12693  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 		 357 aa  295  5e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2481  uroporphyrinogen decarboxylase  50.6 
 
 		 354 aa  295  9e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3919  uroporphyrinogen decarboxylase  47.89 
 
 		 354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  0.515897 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  47.66 
 
 		 359 aa  285  7e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  44.44 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  39.82 
 
 		 345 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  44.12 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1830  uroporphyrinogen decarboxylase  46.75 
 
 		 356 aa  262  6e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  41 
 
 		 345 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 		 348 aa  256  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  37.94 
 
 		 345 aa  256  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  37.94 
 
 		 345 aa  256  5e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  39.3 
 
 		 348 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 		 348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  38.35 
 
 		 357 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  36.52 
 
 		 344 aa  250  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  40.43 
 
 		 351 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  41.74 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  42.55 
 
 		 340 aa  243  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  41.49 
 
 		 339 aa  242  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  42.01 
 
 		 343 aa  242  7e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  40.88 
 
 		 339 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  40.59 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  42.64 
 
 		 357 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  42.42 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  42.12 
 
 		 348 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  38.66 
 
 		 347 aa  226  6e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  42.55 
 
 		 352 aa  225  8e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  40.62 
 
 		 356 aa  225  9e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  38.96 
 
 		 340 aa  223  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 		 351 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  39.08 
 
 		 350 aa  222  7e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  38.86 
 
 		 351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  38.65 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  40.75 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  42.12 
 
 		 354 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  42.12 
 
 		 354 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  41.69 
 
 		 355 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  38.67 
 
 		 351 aa  219  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  42.72 
 
 		 340 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  38.34 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  38.97 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  38.97 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  39.87 
 
 		 354 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  38.67 
 
 		 354 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  40.82 
 
 		 355 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  39.04 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  41.14 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  38.04 
 
 		 354 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  40.19 
 
 		 355 aa  215  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  37.57 
 
 		 351 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  39.43 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  37.91 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  40.18 
 
 		 353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  36.92 
 
 		 354 aa  212  7.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  38.37 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  36.26 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>