More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12693 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12693  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 357 aa  701    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2481  uroporphyrinogen decarboxylase  77.03 
 
 		 354 aa  525  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2201  uroporphyrinogen decarboxylase  75.07 
 
 		 354 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145725  normal  0.153622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2212  uroporphyrinogen decarboxylase  75.07 
 
 		 372 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2258  uroporphyrinogen decarboxylase  75.07 
 
 		 354 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3919  uroporphyrinogen decarboxylase  73.95 
 
 		 354 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  0.515897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  62.08 
 
 		 354 aa  424  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1892  uroporphyrinogen decarboxylase  63.82 
 
 		 357 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  59 
 
 		 353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  60.5 
 
 		 350 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  61.32 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  57.55 
 
 		 345 aa  388  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  55.84 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  58.74 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  57.59 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1474  uroporphyrinogen decarboxylase  58.64 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.000238489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  58.57 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  57.55 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1532  uroporphyrinogen decarboxylase  58.07 
 
 		 371 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.762506  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  56.53 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  55.14 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  59.94 
 
 		 368 aa  364  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  55.34 
 
 		 345 aa  358  7e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1548  uroporphyrinogen decarboxylase  58.05 
 
 		 372 aa  353  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0412889  normal  0.326148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  54.62 
 
 		 345 aa  352  4e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3435  uroporphyrinogen decarboxylase  54.67 
 
 		 354 aa  342  8e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000949597  hitchhiker  0.00324968 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3249  uroporphyrinogen decarboxylase  54 
 
 		 378 aa  339  2.9999999999999998e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36030  uroporphyrinogen decarboxylase  53.41 
 
 		 355 aa  335  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.142165  normal  0.921128 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2494  uroporphyrinogen decarboxylase  52.87 
 
 		 381 aa  330  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2772  uroporphyrinogen decarboxylase  52.59 
 
 		 345 aa  330  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  47.19 
 
 		 345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  48.43 
 
 		 340 aa  328  9e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2485  uroporphyrinogen decarboxylase  51.85 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1585  uroporphyrinogen decarboxylase  53.48 
 
 		 354 aa  321  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  45.66 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4010  uroporphyrinogen decarboxylase  54.02 
 
 		 370 aa  320  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  46.53 
 
 		 345 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  44.8 
 
 		 348 aa  317  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  44.8 
 
 		 348 aa  316  4e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  44.8 
 
 		 348 aa  316  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  44.8 
 
 		 348 aa  316  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  44.8 
 
 		 348 aa  316  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  44.8 
 
 		 348 aa  315  7e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  44.51 
 
 		 348 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  44.51 
 
 		 348 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  44.51 
 
 		 348 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  43.63 
 
 		 357 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15670  uroporphyrinogen decarboxylase  51.14 
 
 		 369 aa  312  6.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.120602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  43.64 
 
 		 345 aa  310  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  43.64 
 
 		 345 aa  310  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  49.86 
 
 		 343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15230  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 		 407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.617606  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  47.11 
 
 		 360 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  42.49 
 
 		 344 aa  301  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  46.82 
 
 		 359 aa  298  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26750  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 		 346 aa  295  6e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.506811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  46.5 
 
 		 348 aa  295  6e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1830  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 		 356 aa  293  4e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  46.02 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  45.4 
 
 		 340 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  44.54 
 
 		 340 aa  279  5e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  44.54 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  44.29 
 
 		 356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  42.49 
 
 		 347 aa  272  6e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  44.32 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  44.32 
 
 		 339 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  41.24 
 
 		 351 aa  269  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  42.74 
 
 		 339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  42.42 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  43.71 
 
 		 352 aa  257  3e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  44.61 
 
 		 340 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  38.72 
 
 		 355 aa  249  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  43.06 
 
 		 350 aa  249  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 		 364 aa  245  8e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  39.5 
 
 		 352 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  38.44 
 
 		 354 aa  245  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  42.18 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  41.13 
 
 		 354 aa  242  6e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  38.94 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  39.88 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  39.78 
 
 		 359 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  39.49 
 
 		 351 aa  241  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  39.83 
 
 		 354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  40.67 
 
 		 354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  40.56 
 
 		 357 aa  239  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  39.55 
 
 		 351 aa  239  4e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  39.83 
 
 		 354 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  39.83 
 
 		 354 aa  238  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0946  uroporphyrinogen decarboxylase  38.28 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  39.83 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  38.55 
 
 		 380 aa  237  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  38.7 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  42.36 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  42.21 
 
 		 354 aa  236  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  40.97 
 
 		 339 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  39.78 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  40.97 
 
 		 342 aa  236  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  41.5 
 
 		 354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0689  uroporphyrinogen decarboxylase  41.52 
 
 		 354 aa  236  6e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  40.11 
 
 		 357 aa  236  6e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>