More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2264 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 
345 aa  688    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  80.17 
 
 
354 aa  560  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  76.74 
 
 
345 aa  535  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  74.63 
 
 
361 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  73.67 
 
 
355 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  64.31 
 
 
401 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  64.33 
 
 
345 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1532  uroporphyrinogen decarboxylase  65 
 
 
371 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.762506  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1474  uroporphyrinogen decarboxylase  64.6 
 
 
365 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.000238489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  63.02 
 
 
360 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  65.26 
 
 
369 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  61.36 
 
 
345 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  63.02 
 
 
355 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  60 
 
 
353 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1892  uroporphyrinogen decarboxylase  60.59 
 
 
357 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15670  uroporphyrinogen decarboxylase  61.42 
 
 
369 aa  398  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.120602  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  56.29 
 
 
340 aa  395  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  59.59 
 
 
368 aa  394  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  60.8 
 
 
354 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1548  uroporphyrinogen decarboxylase  58.26 
 
 
372 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0412889  normal  0.326148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  58.1 
 
 
350 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  53.04 
 
 
360 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2201  uroporphyrinogen decarboxylase  57.1 
 
 
354 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145725  normal  0.153622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12693  uroporphyrinogen decarboxylase  56.53 
 
 
357 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799179  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2212  uroporphyrinogen decarboxylase  57.1 
 
 
372 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2258  uroporphyrinogen decarboxylase  57.1 
 
 
354 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2481  uroporphyrinogen decarboxylase  56.9 
 
 
354 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3435  uroporphyrinogen decarboxylase  54.73 
 
 
354 aa  358  6e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000949597  hitchhiker  0.00324968 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  53.13 
 
 
359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  50.15 
 
 
345 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3919  uroporphyrinogen decarboxylase  55.17 
 
 
354 aa  354  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  0.515897 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  50.59 
 
 
345 aa  352  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  51.59 
 
 
348 aa  349  4e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  52.48 
 
 
352 aa  349  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2485  uroporphyrinogen decarboxylase  52.52 
 
 
353 aa  348  6e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  47.93 
 
 
348 aa  347  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  47.93 
 
 
348 aa  347  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  47.93 
 
 
348 aa  347  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  47.93 
 
 
348 aa  347  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  47.93 
 
 
348 aa  347  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  47.93 
 
 
348 aa  346  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  47.93 
 
 
348 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  47.63 
 
 
348 aa  346  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  47.63 
 
 
348 aa  346  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  47.65 
 
 
348 aa  345  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  47.06 
 
 
357 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1585  uroporphyrinogen decarboxylase  55.2 
 
 
354 aa  342  5e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4010  uroporphyrinogen decarboxylase  53.89 
 
 
370 aa  342  8e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36030  uroporphyrinogen decarboxylase  52.21 
 
 
355 aa  332  7.000000000000001e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.142165  normal  0.921128 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  48.55 
 
 
343 aa  330  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2772  uroporphyrinogen decarboxylase  52.19 
 
 
345 aa  330  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164918  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3249  uroporphyrinogen decarboxylase  52.23 
 
 
378 aa  328  6e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  45.75 
 
 
344 aa  328  8e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2494  uroporphyrinogen decarboxylase  51.9 
 
 
381 aa  327  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15230  uroporphyrinogen decarboxylase  50.43 
 
 
407 aa  323  3e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.617606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  49.4 
 
 
356 aa  322  5e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  44.25 
 
 
345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  44.25 
 
 
345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  46.04 
 
 
351 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26750  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 
346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.506811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  46.73 
 
 
340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  46.13 
 
 
340 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  45.43 
 
 
340 aa  306  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  46.73 
 
 
339 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  45.72 
 
 
339 aa  305  6e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  46.02 
 
 
339 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  46.82 
 
 
352 aa  300  4e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1830  uroporphyrinogen decarboxylase  49.41 
 
 
356 aa  299  5e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  48.99 
 
 
354 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  45.45 
 
 
347 aa  290  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  44.15 
 
 
352 aa  288  7e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  45.45 
 
 
357 aa  287  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  45.9 
 
 
354 aa  285  5.999999999999999e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  39 
 
 
348 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  43.86 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  46.45 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  44.74 
 
 
356 aa  282  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  44.28 
 
 
340 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  43.06 
 
 
351 aa  280  4e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  44.9 
 
 
354 aa  278  8e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  42.24 
 
 
355 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  41.91 
 
 
351 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  45.4 
 
 
351 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  42.44 
 
 
351 aa  277  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  44.89 
 
 
354 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  44.89 
 
 
354 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  42.2 
 
 
351 aa  276  3e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  44.89 
 
 
354 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1118  uroporphyrinogen decarboxylase  43.8 
 
 
366 aa  276  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  44.16 
 
 
354 aa  275  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  42.2 
 
 
351 aa  275  6e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  44.6 
 
 
354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  43.77 
 
 
351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  46.26 
 
 
355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  44.84 
 
 
402 aa  273  4.0000000000000004e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  44.84 
 
 
361 aa  273  5.000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  47.51 
 
 
365 aa  272  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1147  uroporphyrinogen decarboxylase  42.73 
 
 
350 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  43.87 
 
 
354 aa  272  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  44.28 
 
 
350 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>