More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5175 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 
360 aa  706    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  77.53 
 
 
369 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1532  uroporphyrinogen decarboxylase  68.42 
 
 
371 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.762506  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  67.06 
 
 
345 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1474  uroporphyrinogen decarboxylase  67.25 
 
 
365 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.000238489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  63.39 
 
 
345 aa  438  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  63.02 
 
 
345 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  63.11 
 
 
401 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  65 
 
 
354 aa  425  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  62.68 
 
 
354 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  62.28 
 
 
355 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  63.36 
 
 
361 aa  418  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  65.37 
 
 
355 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  63.72 
 
 
353 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  63.42 
 
 
350 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1892  uroporphyrinogen decarboxylase  61.63 
 
 
357 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  63.66 
 
 
368 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  60.24 
 
 
345 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12693  uroporphyrinogen decarboxylase  61.32 
 
 
357 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799179  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15670  uroporphyrinogen decarboxylase  59.94 
 
 
369 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.120602  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2481  uroporphyrinogen decarboxylase  60.29 
 
 
354 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1548  uroporphyrinogen decarboxylase  58.26 
 
 
372 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0412889  normal  0.326148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3435  uroporphyrinogen decarboxylase  59.77 
 
 
354 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000949597  hitchhiker  0.00324968 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3249  uroporphyrinogen decarboxylase  57.73 
 
 
378 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3919  uroporphyrinogen decarboxylase  57.97 
 
 
354 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  0.515897 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2212  uroporphyrinogen decarboxylase  57.97 
 
 
372 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2201  uroporphyrinogen decarboxylase  57.97 
 
 
354 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145725  normal  0.153622 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2258  uroporphyrinogen decarboxylase  57.97 
 
 
354 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1585  uroporphyrinogen decarboxylase  58.91 
 
 
354 aa  359  5e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36030  uroporphyrinogen decarboxylase  55.78 
 
 
355 aa  358  6e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.142165  normal  0.921128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  51.5 
 
 
340 aa  357  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15230  uroporphyrinogen decarboxylase  55.71 
 
 
407 aa  350  2e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.617606  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2485  uroporphyrinogen decarboxylase  53.55 
 
 
353 aa  342  7e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4010  uroporphyrinogen decarboxylase  56.14 
 
 
370 aa  341  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2494  uroporphyrinogen decarboxylase  53.13 
 
 
381 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2772  uroporphyrinogen decarboxylase  55 
 
 
345 aa  335  5e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  47.01 
 
 
345 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  49.13 
 
 
359 aa  333  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  49.38 
 
 
360 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  46.71 
 
 
345 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26750  uroporphyrinogen decarboxylase  52.65 
 
 
346 aa  325  8.000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.506811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  43.32 
 
 
357 aa  319  5e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  43.92 
 
 
348 aa  319  6e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  43.92 
 
 
348 aa  318  7e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  43.92 
 
 
348 aa  318  7e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  43.92 
 
 
348 aa  318  7e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  43.92 
 
 
348 aa  318  7e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  43.92 
 
 
348 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  43.92 
 
 
348 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  43.92 
 
 
348 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  44.31 
 
 
348 aa  317  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  44.31 
 
 
348 aa  315  6e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1830  uroporphyrinogen decarboxylase  53.71 
 
 
356 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  41 
 
 
345 aa  305  6e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  41 
 
 
345 aa  305  6e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  47.08 
 
 
348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  40.94 
 
 
344 aa  301  9e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  45.27 
 
 
356 aa  300  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  46.18 
 
 
352 aa  299  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 
340 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  46.27 
 
 
343 aa  297  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  44.96 
 
 
352 aa  293  3e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  44.18 
 
 
340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  43.88 
 
 
340 aa  289  6e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  43.58 
 
 
339 aa  289  6e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  42.06 
 
 
351 aa  287  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  43.88 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  43.88 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  45.32 
 
 
356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  41.52 
 
 
350 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  41.12 
 
 
347 aa  267  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  41.12 
 
 
349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  40.98 
 
 
354 aa  265  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  41.28 
 
 
354 aa  263  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  40.17 
 
 
350 aa  262  6.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  39.21 
 
 
354 aa  260  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  42.55 
 
 
354 aa  259  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  40.62 
 
 
353 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  39.71 
 
 
354 aa  258  9e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  39.3 
 
 
355 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  39.53 
 
 
380 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  41.11 
 
 
354 aa  258  1e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1118  uroporphyrinogen decarboxylase  40.41 
 
 
366 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5159  uroporphyrinogen decarboxylase  40.79 
 
 
350 aa  257  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  35.93 
 
 
348 aa  256  3e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  44.34 
 
 
340 aa  256  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  40.53 
 
 
354 aa  256  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 
359 aa  256  6e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  39.88 
 
 
355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  39 
 
 
355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  39.23 
 
 
351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  41 
 
 
351 aa  253  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  38.35 
 
 
351 aa  252  8.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  40.59 
 
 
357 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1147  uroporphyrinogen decarboxylase  41.57 
 
 
350 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  39.3 
 
 
355 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  39.12 
 
 
355 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 
354 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  43.24 
 
 
365 aa  249  5e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  39.23 
 
 
354 aa  249  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0124917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>