More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24090 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 353 aa  697    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  71.43 
 
 		 350 aa  488  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  65.46 
 
 		 354 aa  451  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1474  uroporphyrinogen decarboxylase  68.8 
 
 		 365 aa  450  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.000238489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1532  uroporphyrinogen decarboxylase  68.8 
 
 		 371 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.762506  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  67.06 
 
 		 355 aa  433  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1892  uroporphyrinogen decarboxylase  63.99 
 
 		 357 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  63.85 
 
 		 345 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  65.52 
 
 		 369 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  62.94 
 
 		 354 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  62.17 
 
 		 345 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  61.58 
 
 		 355 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  61.58 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  63.72 
 
 		 360 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1548  uroporphyrinogen decarboxylase  65.38 
 
 		 372 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0412889  normal  0.326148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  61.34 
 
 		 401 aa  408  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  60 
 
 		 345 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12693  uroporphyrinogen decarboxylase  59 
 
 		 357 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  61.88 
 
 		 345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2201  uroporphyrinogen decarboxylase  60.22 
 
 		 354 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145725  normal  0.153622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2212  uroporphyrinogen decarboxylase  60.22 
 
 		 372 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2258  uroporphyrinogen decarboxylase  60.22 
 
 		 354 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3919  uroporphyrinogen decarboxylase  59.94 
 
 		 354 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  0.515897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2772  uroporphyrinogen decarboxylase  61.58 
 
 		 345 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2494  uroporphyrinogen decarboxylase  60.41 
 
 		 381 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1585  uroporphyrinogen decarboxylase  60.74 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3435  uroporphyrinogen decarboxylase  60.64 
 
 		 354 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000949597  hitchhiker  0.00324968 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  60.88 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2481  uroporphyrinogen decarboxylase  59.1 
 
 		 354 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15670  uroporphyrinogen decarboxylase  62.5 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.120602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15230  uroporphyrinogen decarboxylase  57.46 
 
 		 407 aa  375  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.617606  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36030  uroporphyrinogen decarboxylase  59.24 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.142165  normal  0.921128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3249  uroporphyrinogen decarboxylase  56.99 
 
 		 378 aa  365  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2485  uroporphyrinogen decarboxylase  55.81 
 
 		 353 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4010  uroporphyrinogen decarboxylase  56.02 
 
 		 370 aa  353  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26750  uroporphyrinogen decarboxylase  54.07 
 
 		 346 aa  342  5e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.506811  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  49.7 
 
 		 340 aa  329  5.0000000000000004e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  47.48 
 
 		 348 aa  328  9e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  47.67 
 
 		 345 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  47.62 
 
 		 345 aa  326  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  46.59 
 
 		 348 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  46.59 
 
 		 348 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  46.59 
 
 		 348 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  46.59 
 
 		 348 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  46.59 
 
 		 348 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  46.59 
 
 		 348 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  46.59 
 
 		 348 aa  324  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  46.59 
 
 		 348 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  46.59 
 
 		 348 aa  323  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  44.97 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  47.46 
 
 		 360 aa  320  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  44.77 
 
 		 357 aa  319  6e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  50.89 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  43.57 
 
 		 345 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  43.57 
 
 		 345 aa  313  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1830  uroporphyrinogen decarboxylase  52.94 
 
 		 356 aa  311  9e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  47.81 
 
 		 343 aa  294  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  46.61 
 
 		 340 aa  293  4e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  47.49 
 
 		 340 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  47.73 
 
 		 348 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  45.43 
 
 		 339 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  46.02 
 
 		 340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  45.29 
 
 		 339 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  45.29 
 
 		 339 aa  281  9e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  46.06 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  43.21 
 
 		 351 aa  275  7e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  44.19 
 
 		 347 aa  275  7e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  45.45 
 
 		 356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  45.51 
 
 		 352 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  44.26 
 
 		 356 aa  269  7e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  43.5 
 
 		 351 aa  268  7e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  42.36 
 
 		 351 aa  268  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  46.47 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  42.53 
 
 		 351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  42.18 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  42.42 
 
 		 351 aa  263  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  41.09 
 
 		 351 aa  262  6e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  42.24 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  42.24 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  44.71 
 
 		 350 aa  260  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  44.71 
 
 		 357 aa  260  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  38.05 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  44.58 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  41.32 
 
 		 355 aa  256  5e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  43.98 
 
 		 364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  44.44 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  43.84 
 
 		 355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  43.64 
 
 		 352 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  44.14 
 
 		 355 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  43.2 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  42.77 
 
 		 354 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  43.93 
 
 		 354 aa  250  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  42.77 
 
 		 354 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  43.07 
 
 		 354 aa  249  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  42.17 
 
 		 354 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  41.02 
 
 		 354 aa  250  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  42.47 
 
 		 354 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  43.98 
 
 		 357 aa  249  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  44.28 
 
 		 360 aa  249  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  41.87 
 
 		 354 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>