More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1921 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 345 aa  712    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 345 aa  712    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  84.59 
 
 		 344 aa  620  1e-176  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  68.99 
 
 		 345 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  65.89 
 
 		 345 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  66.57 
 
 		 357 aa  500  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  66.57 
 
 		 348 aa  495  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  66.28 
 
 		 348 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  66.28 
 
 		 348 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  65.99 
 
 		 348 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  66.28 
 
 		 348 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  66.28 
 
 		 348 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  66.28 
 
 		 348 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  65.99 
 
 		 348 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  66.28 
 
 		 348 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  65.7 
 
 		 348 aa  488  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  46.2 
 
 		 345 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  46.75 
 
 		 359 aa  330  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  45.29 
 
 		 355 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  45 
 
 		 361 aa  326  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  44.28 
 
 		 345 aa  326  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 401 aa  325  7e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  45.03 
 
 		 354 aa  323  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  44.94 
 
 		 340 aa  322  8e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  44.25 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  44.12 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  42.23 
 
 		 368 aa  316  3e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1532  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 371 aa  316  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.762506  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  43.57 
 
 		 353 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12693  uroporphyrinogen decarboxylase  43.64 
 
 		 357 aa  310  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1474  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 365 aa  309  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.000238489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1892  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 		 357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  41 
 
 		 360 aa  305  6e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  42.73 
 
 		 360 aa  305  7e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  42.34 
 
 		 369 aa  305  8.000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  43.4 
 
 		 352 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  41.64 
 
 		 355 aa  302  5.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 		 350 aa  302  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  42.41 
 
 		 348 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  44.74 
 
 		 340 aa  295  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  43.07 
 
 		 354 aa  295  9e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  43.11 
 
 		 356 aa  295  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  43.99 
 
 		 339 aa  292  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  44.44 
 
 		 340 aa  292  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  44.88 
 
 		 343 aa  291  9e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1830  uroporphyrinogen decarboxylase  42.32 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  44.44 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15670  uroporphyrinogen decarboxylase  41.47 
 
 		 369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.120602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3435  uroporphyrinogen decarboxylase  39.36 
 
 		 354 aa  286  4e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000949597  hitchhiker  0.00324968 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  42.52 
 
 		 339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  42.52 
 
 		 339 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  41.23 
 
 		 351 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36030  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 		 355 aa  279  6e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.142165  normal  0.921128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1548  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0412889  normal  0.326148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2481  uroporphyrinogen decarboxylase  42.11 
 
 		 354 aa  276  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2212  uroporphyrinogen decarboxylase  40.92 
 
 		 372 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2772  uroporphyrinogen decarboxylase  41.23 
 
 		 345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164918  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2201  uroporphyrinogen decarboxylase  40.92 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145725  normal  0.153622 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2258  uroporphyrinogen decarboxylase  40.92 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1585  uroporphyrinogen decarboxylase  41.88 
 
 		 354 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  40.76 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  39.47 
 
 		 347 aa  269  5.9999999999999995e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3919  uroporphyrinogen decarboxylase  42.57 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  0.515897 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2494  uroporphyrinogen decarboxylase  40.35 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2485  uroporphyrinogen decarboxylase  38.24 
 
 		 353 aa  265  7e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3249  uroporphyrinogen decarboxylase  38.08 
 
 		 378 aa  265  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  40.48 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  41.35 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  41.55 
 
 		 354 aa  262  4.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  40.35 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  39.07 
 
 		 352 aa  258  8e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  41.09 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  40.47 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  40.06 
 
 		 351 aa  256  4e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26750  uroporphyrinogen decarboxylase  37.94 
 
 		 346 aa  256  5e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.506811  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  40.06 
 
 		 351 aa  255  9e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15230  uroporphyrinogen decarboxylase  36.75 
 
 		 407 aa  254  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.617606  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  38.78 
 
 		 364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  39.18 
 
 		 351 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  37.75 
 
 		 352 aa  253  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  39.47 
 
 		 353 aa  250  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  39.08 
 
 		 355 aa  249  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 		 351 aa  249  6e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4010  uroporphyrinogen decarboxylase  38.37 
 
 		 370 aa  249  7e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  37.75 
 
 		 365 aa  248  9e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  38.79 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  40.24 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  39.08 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  41.35 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  36.55 
 
 		 351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  36.44 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  37.18 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  39.24 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  38.04 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  39.02 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  37.61 
 
 		 355 aa  242  5e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  37.75 
 
 		 354 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  38.18 
 
 		 354 aa  242  9e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  38.18 
 
 		 354 aa  241  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  38.18 
 
 		 354 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>