More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1368 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 344 aa  709    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  84.59 
 
 		 345 aa  620  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  84.59 
 
 		 345 aa  620  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  67.06 
 
 		 345 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  66.37 
 
 		 345 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  64.91 
 
 		 357 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  65.2 
 
 		 348 aa  490  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  65.2 
 
 		 348 aa  489  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  64.91 
 
 		 348 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  65.2 
 
 		 348 aa  490  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  65.2 
 
 		 348 aa  490  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  65.2 
 
 		 348 aa  489  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  64.91 
 
 		 348 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  65.2 
 
 		 348 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  65.2 
 
 		 348 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  64.62 
 
 		 348 aa  486  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  46.92 
 
 		 355 aa  337  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  46.92 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  46.04 
 
 		 361 aa  332  6e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  45.61 
 
 		 354 aa  330  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  45.75 
 
 		 345 aa  328  8e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  45.19 
 
 		 401 aa  328  9e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  45.54 
 
 		 340 aa  325  7e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  44.21 
 
 		 345 aa  323  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  45.56 
 
 		 359 aa  322  7e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1532  uroporphyrinogen decarboxylase  44.87 
 
 		 371 aa  321  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.762506  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  44.97 
 
 		 353 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  43.11 
 
 		 368 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  43.82 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1474  uroporphyrinogen decarboxylase  45.16 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.000238489 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  43.02 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  43.35 
 
 		 348 aa  310  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  43.44 
 
 		 352 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1892  uroporphyrinogen decarboxylase  42.52 
 
 		 357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  43.53 
 
 		 350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  43.7 
 
 		 356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  40.94 
 
 		 360 aa  301  8.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  45.91 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12693  uroporphyrinogen decarboxylase  42.49 
 
 		 357 aa  301  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  41.62 
 
 		 369 aa  300  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  45.32 
 
 		 340 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  44.87 
 
 		 339 aa  294  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  43.6 
 
 		 343 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  40.76 
 
 		 355 aa  292  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 		 354 aa  291  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15670  uroporphyrinogen decarboxylase  41.76 
 
 		 369 aa  290  2e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.120602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  44.15 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  41.91 
 
 		 351 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3435  uroporphyrinogen decarboxylase  39.65 
 
 		 354 aa  289  6e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000949597  hitchhiker  0.00324968 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  43.11 
 
 		 339 aa  286  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  43.11 
 
 		 339 aa  285  9e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36030  uroporphyrinogen decarboxylase  38.86 
 
 		 355 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.142165  normal  0.921128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1548  uroporphyrinogen decarboxylase  39.88 
 
 		 372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0412889  normal  0.326148 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1830  uroporphyrinogen decarboxylase  41.64 
 
 		 356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2212  uroporphyrinogen decarboxylase  41.11 
 
 		 372 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2201  uroporphyrinogen decarboxylase  41.11 
 
 		 354 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145725  normal  0.153622 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2258  uroporphyrinogen decarboxylase  41.11 
 
 		 354 aa  275  7e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1585  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2481  uroporphyrinogen decarboxylase  41.98 
 
 		 354 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2772  uroporphyrinogen decarboxylase  39.77 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164918  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3249  uroporphyrinogen decarboxylase  37.64 
 
 		 378 aa  270  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2494  uroporphyrinogen decarboxylase  39.47 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  40.18 
 
 		 356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3919  uroporphyrinogen decarboxylase  42.15 
 
 		 354 aa  269  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  0.515897 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  39.47 
 
 		 347 aa  268  8e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  41.79 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  41.38 
 
 		 351 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  40.63 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  40.18 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  39.88 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  40.35 
 
 		 351 aa  262  4.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  41.83 
 
 		 354 aa  263  4.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2485  uroporphyrinogen decarboxylase  37.65 
 
 		 353 aa  262  6e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  40.06 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15230  uroporphyrinogen decarboxylase  36.96 
 
 		 407 aa  257  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.617606  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  39.18 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  38.79 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4010  uroporphyrinogen decarboxylase  38.55 
 
 		 370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  38.15 
 
 		 364 aa  253  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  38.9 
 
 		 351 aa  251  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26750  uroporphyrinogen decarboxylase  36.52 
 
 		 346 aa  250  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.506811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  39.66 
 
 		 355 aa  249  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  39.54 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  40.88 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  38.97 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  37.57 
 
 		 352 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  39.08 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  38.42 
 
 		 339 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  37.54 
 
 		 341 aa  246  6e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  38.97 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  38.84 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  37.57 
 
 		 365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  37.79 
 
 		 348 aa  242  5e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  39.08 
 
 		 354 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  38.79 
 
 		 354 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.300698 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  38.79 
 
 		 354 aa  242  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  38.79 
 
 		 354 aa  242  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  38.79 
 
 		 354 aa  242  6e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  38.79 
 
 		 354 aa  242  6e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>