More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1474 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1532  uroporphyrinogen decarboxylase  91.23 
 
 		 371 aa  649    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.762506  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1474  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 365 aa  722    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.000238489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  68.71 
 
 		 345 aa  463  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  68.8 
 
 		 353 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  66.17 
 
 		 355 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  65.88 
 
 		 345 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  64.6 
 
 		 345 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  65.69 
 
 		 354 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  64.55 
 
 		 401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  68.82 
 
 		 369 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  67.25 
 
 		 360 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  66.77 
 
 		 361 aa  451  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  65.49 
 
 		 355 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  67.46 
 
 		 368 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  64.71 
 
 		 350 aa  425  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1892  uroporphyrinogen decarboxylase  65.2 
 
 		 357 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  63.48 
 
 		 354 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  63.88 
 
 		 345 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15670  uroporphyrinogen decarboxylase  63.5 
 
 		 369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.120602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2201  uroporphyrinogen decarboxylase  62.14 
 
 		 354 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145725  normal  0.153622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2212  uroporphyrinogen decarboxylase  62.14 
 
 		 372 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2258  uroporphyrinogen decarboxylase  62.14 
 
 		 354 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12693  uroporphyrinogen decarboxylase  58.64 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1548  uroporphyrinogen decarboxylase  60.77 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0412889  normal  0.326148 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1585  uroporphyrinogen decarboxylase  59.54 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2481  uroporphyrinogen decarboxylase  60.98 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2494  uroporphyrinogen decarboxylase  56.3 
 
 		 381 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2772  uroporphyrinogen decarboxylase  58.06 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164918  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3919  uroporphyrinogen decarboxylase  58.38 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  0.515897 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3249  uroporphyrinogen decarboxylase  60.64 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36030  uroporphyrinogen decarboxylase  58.46 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.142165  normal  0.921128 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3435  uroporphyrinogen decarboxylase  58.6 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000949597  hitchhiker  0.00324968 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2485  uroporphyrinogen decarboxylase  56.51 
 
 		 353 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  52.4 
 
 		 340 aa  359  5e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4010  uroporphyrinogen decarboxylase  56.07 
 
 		 370 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15230  uroporphyrinogen decarboxylase  54.55 
 
 		 407 aa  349  5e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.617606  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  54.09 
 
 		 359 aa  348  6e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  48.82 
 
 		 348 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  49.11 
 
 		 345 aa  346  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  47.65 
 
 		 345 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  47.63 
 
 		 348 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  47.63 
 
 		 348 aa  342  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  47.63 
 
 		 348 aa  342  8e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  47.63 
 
 		 348 aa  342  8e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  47.63 
 
 		 348 aa  342  8e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  47.63 
 
 		 348 aa  342  8e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  47.63 
 
 		 348 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  47.63 
 
 		 348 aa  341  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  47.63 
 
 		 348 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  47.31 
 
 		 360 aa  339  5e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  47.04 
 
 		 357 aa  339  5e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26750  uroporphyrinogen decarboxylase  53.85 
 
 		 346 aa  333  4e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.506811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  50.15 
 
 		 340 aa  329  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  45.16 
 
 		 344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  48.97 
 
 		 340 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  48.39 
 
 		 340 aa  325  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  50.73 
 
 		 343 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1830  uroporphyrinogen decarboxylase  51.16 
 
 		 356 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  44.57 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  44.84 
 
 		 351 aa  319  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  47.8 
 
 		 339 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  48.08 
 
 		 339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  48.08 
 
 		 339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  48.1 
 
 		 348 aa  309  5e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  47.62 
 
 		 356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  47.51 
 
 		 352 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  46.2 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  48.38 
 
 		 340 aa  298  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  46.11 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  44.61 
 
 		 354 aa  281  9e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  43.82 
 
 		 350 aa  278  9e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  43.99 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  43.99 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  43.99 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  43.99 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  43.99 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  46.4 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  43.99 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  43.99 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  43.99 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  43.99 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  43.15 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  37.5 
 
 		 348 aa  276  3e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  40.29 
 
 		 355 aa  276  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  42.23 
 
 		 354 aa  276  4e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  45.19 
 
 		 365 aa  276  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  43.44 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  43.97 
 
 		 357 aa  276  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  43.15 
 
 		 354 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 354 aa  275  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  42.52 
 
 		 364 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  43.15 
 
 		 354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  43.06 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  43.44 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  42.11 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  43.44 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  43.15 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 354 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.91714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>