More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1382 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 368 aa  716    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1532  uroporphyrinogen decarboxylase  65.41 
 
 		 371 aa  428  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.762506  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  62.54 
 
 		 345 aa  421  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1474  uroporphyrinogen decarboxylase  67.46 
 
 		 365 aa  421  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.000238489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1334  uroporphyrinogen decarboxylase  63.64 
 
 		 369 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0406905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  62.57 
 
 		 401 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1899  uroporphyrinogen decarboxylase  60.88 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  63.66 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  60.18 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  59.59 
 
 		 345 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  60.88 
 
 		 353 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1889  uroporphyrinogen decarboxylase  60.65 
 
 		 355 aa  388  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  59.59 
 
 		 354 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  60.3 
 
 		 350 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  60.47 
 
 		 345 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1892  uroporphyrinogen decarboxylase  58.43 
 
 		 357 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  60.24 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12693  uroporphyrinogen decarboxylase  59.94 
 
 		 357 aa  364  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2212  uroporphyrinogen decarboxylase  57.97 
 
 		 372 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2201  uroporphyrinogen decarboxylase  57.97 
 
 		 354 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145725  normal  0.153622 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2258  uroporphyrinogen decarboxylase  57.97 
 
 		 354 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3435  uroporphyrinogen decarboxylase  57.4 
 
 		 354 aa  360  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000949597  hitchhiker  0.00324968 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1548  uroporphyrinogen decarboxylase  57.95 
 
 		 372 aa  359  4e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0412889  normal  0.326148 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36030  uroporphyrinogen decarboxylase  56.32 
 
 		 355 aa  355  5e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.142165  normal  0.921128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  55.85 
 
 		 354 aa  355  1e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2481  uroporphyrinogen decarboxylase  60.06 
 
 		 354 aa  349  4e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1585  uroporphyrinogen decarboxylase  57.1 
 
 		 354 aa  343  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3249  uroporphyrinogen decarboxylase  55.59 
 
 		 378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2772  uroporphyrinogen decarboxylase  55.59 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.164918  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4010  uroporphyrinogen decarboxylase  57.58 
 
 		 370 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3919  uroporphyrinogen decarboxylase  56.71 
 
 		 354 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  0.515897 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15670  uroporphyrinogen decarboxylase  55.82 
 
 		 369 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.120602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26750  uroporphyrinogen decarboxylase  53.98 
 
 		 346 aa  332  4e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.506811  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2494  uroporphyrinogen decarboxylase  55.29 
 
 		 381 aa  332  5e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2485  uroporphyrinogen decarboxylase  53.13 
 
 		 353 aa  329  6e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  49.85 
 
 		 340 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1368  uroporphyrinogen decarboxylase  43.11 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15230  uroporphyrinogen decarboxylase  52.16 
 
 		 407 aa  321  9.999999999999999e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.617606  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1921  uroporphyrinogen decarboxylase  42.23 
 
 		 345 aa  316  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000898972  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1887  uroporphyrinogen decarboxylase  42.23 
 
 		 345 aa  316  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0259223  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  49.27 
 
 		 359 aa  316  4e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  44.31 
 
 		 345 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  44.19 
 
 		 348 aa  315  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  47.26 
 
 		 360 aa  315  7e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  45.72 
 
 		 345 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 		 348 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 		 348 aa  309  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 		 348 aa  309  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 		 348 aa  309  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 		 348 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 		 348 aa  309  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 		 348 aa  309  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 		 348 aa  309  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 		 348 aa  308  8e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  42.57 
 
 		 357 aa  305  6e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1830  uroporphyrinogen decarboxylase  50 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  46.15 
 
 		 356 aa  301  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  46.94 
 
 		 348 aa  298  8e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  46.61 
 
 		 340 aa  295  6e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  46.02 
 
 		 340 aa  293  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  45.8 
 
 		 352 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  41.94 
 
 		 351 aa  293  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  46.31 
 
 		 340 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  46.43 
 
 		 339 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  45.54 
 
 		 339 aa  286  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  46.13 
 
 		 339 aa  285  7e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  47.18 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 354 aa  268  8e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  47.65 
 
 		 340 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  43.75 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  43.86 
 
 		 359 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  42.57 
 
 		 365 aa  263  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  41.21 
 
 		 355 aa  262  6.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  43.86 
 
 		 355 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  45.33 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  43.86 
 
 		 355 aa  259  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  44.54 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  43.55 
 
 		 353 aa  258  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  41.81 
 
 		 355 aa  256  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 		 354 aa  255  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 355 aa  255  8e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  42.82 
 
 		 355 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  41.98 
 
 		 354 aa  255  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  42.86 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  42.23 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  41.69 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  42.82 
 
 		 355 aa  253  5.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  42.61 
 
 		 354 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  42.82 
 
 		 355 aa  253  5.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  44.02 
 
 		 352 aa  252  7e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  41.69 
 
 		 354 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  42.57 
 
 		 354 aa  252  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  43.7 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  42.82 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  42.82 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  42.82 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  42.82 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  42.82 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  43.84 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>