More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1216 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1216  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 
350 aa  708    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1147  uroporphyrinogen decarboxylase  99.71 
 
 
350 aa  706    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1088  uroporphyrinogen decarboxylase  98.29 
 
 
350 aa  697    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1128  uroporphyrinogen decarboxylase  88.57 
 
 
350 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.320103  decreased coverage  0.00101807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  53.45 
 
 
354 aa  331  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  47.13 
 
 
340 aa  315  7e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  46.84 
 
 
340 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  48.1 
 
 
340 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  46.4 
 
 
339 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  45.53 
 
 
339 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  46.11 
 
 
339 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  47.54 
 
 
359 aa  305  6e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  46.72 
 
 
348 aa  300  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  46.51 
 
 
343 aa  299  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  46.31 
 
 
357 aa  296  4e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  43.22 
 
 
355 aa  295  6e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  47.16 
 
 
351 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  45.27 
 
 
350 aa  292  6e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  44.73 
 
 
354 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  45.11 
 
 
352 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  44.67 
 
 
380 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0619  uroporphyrinogen decarboxylase  47.23 
 
 
340 aa  290  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  45.66 
 
 
354 aa  289  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  47.24 
 
 
367 aa  288  7e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  44.96 
 
 
355 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  44.96 
 
 
355 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  44.96 
 
 
355 aa  287  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1103  uroporphyrinogen decarboxylase  42.98 
 
 
348 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  46.96 
 
 
367 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  44.93 
 
 
365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  43.1 
 
 
360 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  43.22 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1167  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0999  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0984  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0986  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1070  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0649  uroporphyrinogen decarboxylase  43.1 
 
 
345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1230  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1152  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 
348 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  44.99 
 
 
356 aa  282  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4202  uroporphyrinogen decarboxylase  42.69 
 
 
348 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  44.06 
 
 
354 aa  282  7.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0124917 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  43.75 
 
 
354 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  43.75 
 
 
354 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  45.35 
 
 
354 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  45.35 
 
 
354 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  43.75 
 
 
354 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  43.75 
 
 
354 aa  281  8.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  43.75 
 
 
354 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  43.75 
 
 
354 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  43.75 
 
 
354 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  43.75 
 
 
354 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  43.75 
 
 
354 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  43.75 
 
 
354 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  45.43 
 
 
345 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  43.9 
 
 
340 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  44.35 
 
 
354 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  44.06 
 
 
354 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  44.93 
 
 
357 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  45.22 
 
 
353 aa  280  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  44.06 
 
 
354 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3303  uroporphyrinogen decarboxylase  46.13 
 
 
364 aa  280  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0163615  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  43.06 
 
 
355 aa  279  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  44.06 
 
 
354 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  44.06 
 
 
354 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  42.9 
 
 
355 aa  279  6e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  44.44 
 
 
354 aa  279  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  43.06 
 
 
355 aa  279  6e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  41.76 
 
 
354 aa  279  6e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  43.77 
 
 
354 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  45.61 
 
 
355 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  45.61 
 
 
355 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  43.34 
 
 
359 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  44.03 
 
 
354 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  43.47 
 
 
354 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  43.77 
 
 
354 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  42.57 
 
 
351 aa  277  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  43.31 
 
 
345 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  43.47 
 
 
356 aa  277  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  42.53 
 
 
345 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0824  uroporphyrinogen decarboxylase  41.74 
 
 
357 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  45.33 
 
 
355 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  46.67 
 
 
364 aa  276  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  45.61 
 
 
355 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  42.66 
 
 
355 aa  276  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0989  uroporphyrinogen decarboxylase  41.83 
 
 
348 aa  275  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  42.4 
 
 
353 aa  275  7e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  43.47 
 
 
354 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  42.94 
 
 
340 aa  275  9e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  44.64 
 
 
360 aa  275  9e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  43.75 
 
 
354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  43.18 
 
 
354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  44.48 
 
 
355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  45.04 
 
 
364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  42.78 
 
 
355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  45.56 
 
 
364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  45.04 
 
 
364 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  45.04 
 
 
364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  45.04 
 
 
364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>