14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0134 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0134  uroporphyrinogen-III decarboxylase  100 
 
 		 343 aa  710    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0135  uroporphyrinogen-III decarboxylase  44.65 
 
 		 333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2358  hypothetical protein  32.93 
 
 		 335 aa  170  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0866  uroporphyrinogen decarboxylase  32.52 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00770341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5441  uroporphyrinogen decarboxylase  25.91 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104198  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2260  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  26.4 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000313707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0626  uroporphyrinogen decarboxylase  29.09 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464405  normal  0.107991 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  22.67 
 
 		 448 aa  50.1  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1314  hypothetical protein  24.58 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.42967 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  26.09 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.94 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  20.51 
 
 		 363 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  20.51 
 
 		 363 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  20.51 
 
 		 363 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>