37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2260 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2260  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  100 
 
 		 330 aa  669    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000313707  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5441  uroporphyrinogen decarboxylase  36.5 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0626  uroporphyrinogen decarboxylase  33.23 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464405  normal  0.107991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0866  uroporphyrinogen decarboxylase  35.4 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00770341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3790  hypothetical protein  25.11 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  23.63 
 
 		 349 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2358  hypothetical protein  21.47 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0135  uroporphyrinogen-III decarboxylase  20.72 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0134  uroporphyrinogen-III decarboxylase  26.4 
 
 		 343 aa  67  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.5 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  22.33 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.85 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.12 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.89 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  24.12 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.3 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.89 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.11 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  22.64 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  22.35 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  20.83 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.11 
 
 		 338 aa  53.9  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  22.4 
 
 		 372 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  21.7 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  19.88 
 
 		 363 aa  52.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.32 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  22.61 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  23.46 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  22.73 
 
 		 556 aa  50.4  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  20.59 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  19.33 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  19.67 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.23 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  21.56 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  23.61 
 
 		 386 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  24.15 
 
 		 617 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  23.18 
 
 		 350 aa  42.7  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>