28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0626 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0626  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 
333 aa  678    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464405  normal  0.107991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0866  uroporphyrinogen decarboxylase  86.32 
 
 
328 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00770341  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5441  uroporphyrinogen decarboxylase  36.89 
 
 
334 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104198  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2260  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  33.54 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000313707  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3790  hypothetical protein  26.54 
 
 
312 aa  93.2  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0134  uroporphyrinogen-III decarboxylase  29.09 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.25 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  22.44 
 
 
372 aa  62.4  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.5 
 
 
375 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  23.28 
 
 
363 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  22.99 
 
 
363 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0135  uroporphyrinogen-III decarboxylase  18.15 
 
 
333 aa  53.5  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  20.11 
 
 
342 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  25.15 
 
 
357 aa  53.5  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  21.74 
 
 
342 aa  52.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  22.7 
 
 
363 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  24.15 
 
 
350 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  21.49 
 
 
342 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  21.45 
 
 
338 aa  49.7  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  18.88 
 
 
339 aa  46.2  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  24.85 
 
 
335 aa  46.2  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  20.96 
 
 
344 aa  46.2  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  20.29 
 
 
339 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  22.22 
 
 
339 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  25.17 
 
 
556 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  22.66 
 
 
335 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  21.65 
 
 
349 aa  43.5  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  28.37 
 
 
356 aa  43.5  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>