151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2069 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  100 
 
 
348 aa  720    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  46.67 
 
 
338 aa  326  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  44.35 
 
 
350 aa  322  6e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  44.38 
 
 
349 aa  301  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  31.25 
 
 
345 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  32.14 
 
 
339 aa  175  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  32.13 
 
 
367 aa  172  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.84 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.7 
 
 
344 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.38 
 
 
339 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.94 
 
 
342 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.72 
 
 
310 aa  143  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.5 
 
 
342 aa  142  8e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.87 
 
 
342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.57 
 
 
341 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.08 
 
 
339 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.44 
 
 
355 aa  123  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.71 
 
 
348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.07 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  26.84 
 
 
335 aa  110  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  24.71 
 
 
372 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  22.73 
 
 
363 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1430  uroporphyrinogen decarboxylase  24.57 
 
 
345 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000852244  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  22.73 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  22.44 
 
 
363 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  22.8 
 
 
358 aa  90.1  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2887  uroporphyrinogen decarboxylase  29.19 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 
348 aa  87  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  25.19 
 
 
319 aa  83.6  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  22.42 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  25.36 
 
 
448 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  28.03 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  22.41 
 
 
357 aa  79.3  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  24.21 
 
 
556 aa  76.3  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  24.01 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  24.28 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  24.75 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  24.19 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  21.9 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  23.59 
 
 
343 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  25.52 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  25.68 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  32.31 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2386  methylcobamide:CoM methyltransferase-related protein  22.81 
 
 
341 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0422  uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  27.27 
 
 
293 aa  63.9  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  22.11 
 
 
340 aa  63.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  25.25 
 
 
354 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  25.25 
 
 
354 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0079  uroporphyrinogen decarboxylase  26.42 
 
 
287 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0659182  hitchhiker  0.00575431 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  23.41 
 
 
617 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  22.87 
 
 
340 aa  59.7  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  26.6 
 
 
287 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  22.73 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  22.73 
 
 
339 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  21.58 
 
 
340 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  29.23 
 
 
351 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  28.98 
 
 
354 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  28.98 
 
 
354 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1823  uroporphyrinogen decarboxylase  26.03 
 
 
287 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.952283  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  25.56 
 
 
354 aa  57  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4642  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  28.82 
 
 
382 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28976  predicted protein  23.45 
 
 
365 aa  56.6  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0707495  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  23.04 
 
 
353 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  21.43 
 
 
339 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  26.67 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1028  uroporphyrinogen decarboxylase  24.72 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26160  hypothetical protein  23.27 
 
 
296 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  26.91 
 
 
355 aa  53.5  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  26.01 
 
 
359 aa  53.1  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  24.37 
 
 
380 aa  53.1  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  27.18 
 
 
351 aa  52.8  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  23.58 
 
 
354 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  25.11 
 
 
354 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  25.64 
 
 
351 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  25.31 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  23.2 
 
 
353 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  22.71 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  26.16 
 
 
355 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  23.32 
 
 
354 aa  50.8  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4338  uroporphyrinogen decarboxylase  21.99 
 
 
354 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332252  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  24.79 
 
 
355 aa  50.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31578  predicted protein  21.58 
 
 
362 aa  50.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.667857  normal  0.0330818 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  26.16 
 
 
355 aa  50.4  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  26.16 
 
 
355 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  25.57 
 
 
354 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  25.57 
 
 
354 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  23.08 
 
 
350 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  25.57 
 
 
354 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  25.57 
 
 
354 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  25.57 
 
 
354 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  25.57 
 
 
354 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  25.57 
 
 
354 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  25.57 
 
 
354 aa  50.1  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  25.57 
 
 
354 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  27.91 
 
 
357 aa  49.7  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  25.11 
 
 
355 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  24.16 
 
 
352 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  23.66 
 
 
346 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  24.66 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  25.57 
 
 
354 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.91714 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>