254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1688 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  100 
 
 
341 aa  694    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  55.59 
 
 
345 aa  413  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  51.96 
 
 
310 aa  359  4e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  43.53 
 
 
339 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  45.59 
 
 
338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  46.18 
 
 
339 aa  301  8.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  35.71 
 
 
339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  32.84 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.62 
 
 
344 aa  199  7e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  34.32 
 
 
349 aa  196  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.23 
 
 
367 aa  188  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.63 
 
 
342 aa  180  4e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.04 
 
 
342 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.23 
 
 
342 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  31.5 
 
 
348 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  32.15 
 
 
350 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  28.57 
 
 
348 aa  146  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.57 
 
 
355 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.14 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  28.82 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  27.62 
 
 
363 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  27.33 
 
 
363 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  27.33 
 
 
363 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  24.86 
 
 
357 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  26.09 
 
 
363 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  28.57 
 
 
319 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  26.96 
 
 
335 aa  106  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  24.57 
 
 
358 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  27.35 
 
 
337 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  25.41 
 
 
556 aa  89.7  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  28.51 
 
 
375 aa  87.8  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.26 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  26.63 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  23.6 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  27.01 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  27.94 
 
 
448 aa  80.5  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  26.37 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  24.93 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  24.93 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0079  uroporphyrinogen decarboxylase  27.83 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0659182  hitchhiker  0.00575431 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  24.36 
 
 
351 aa  77  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  25.57 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  27.76 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  23.74 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  25.71 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26160  hypothetical protein  29.84 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  25.07 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  22.65 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  22.65 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1823  uroporphyrinogen decarboxylase  27.39 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.952283  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  24.3 
 
 
355 aa  72.4  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  26.96 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  22.83 
 
 
348 aa  72  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  23.21 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  24.31 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0134  uroporphyrinogen decarboxylase  24.91 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106114  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  24.19 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  25.55 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  24.21 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  23.5 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  24.1 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  24.73 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  25.29 
 
 
343 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  23.42 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3890  uroporphyrinogen decarboxylase  23.61 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  23.89 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  23.82 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  24.23 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  24.1 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  25.66 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  24.1 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  24.1 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  25.33 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3342  uroporphyrinogen decarboxylase  25.9 
 
 
363 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0599  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  25.19 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0170  uroporphyrinogen decarboxylase  23.82 
 
 
405 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  26.24 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0705  uroporphyrinogen decarboxylase  24.11 
 
 
365 aa  66.2  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10691  uroporphyrinogen decarboxylase  25.07 
 
 
351 aa  66.2  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.88253  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  22.54 
 
 
353 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2887  uroporphyrinogen decarboxylase  27 
 
 
354 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  23.97 
 
 
359 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2962  uroporphyrinogen decarboxylase  23.82 
 
 
405 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3023  uroporphyrinogen decarboxylase  23.45 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  24.85 
 
 
339 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02179  uroporphyrinogen decarboxylase  24.46 
 
 
354 aa  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  25.21 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  23.57 
 
 
351 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  24.49 
 
 
352 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  24.85 
 
 
339 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20757  uroporphyrinogen decarboxylase  26.05 
 
 
431 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0771142  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  23.65 
 
 
365 aa  64.7  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  25.34 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  22.57 
 
 
350 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  24.2 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  21.78 
 
 
351 aa  64.3  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  24.08 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  22.69 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1430  uroporphyrinogen decarboxylase  22.16 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000852244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>