45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0079 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0079  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 287 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0659182  hitchhiker  0.00575431 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  93.03 
 
 		 287 aa  545  1e-154  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1823  uroporphyrinogen decarboxylase  93.03 
 
 		 287 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.952283  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0422  uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  40 
 
 		 293 aa  261  8e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  35.14 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.72 
 
 		 348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  34.23 
 
 		 342 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  34.23 
 
 		 342 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26160  hypothetical protein  26.83 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.61 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  31.28 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  31.02 
 
 		 339 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.68 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.36 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.6 
 
 		 339 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.31 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  28.32 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.37 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  26.88 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.4 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  29.31 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.56 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.09 
 
 		 341 aa  68.9  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.79 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  29.31 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  28.74 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  27.44 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  26.55 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  26.42 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  26.17 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  25 
 
 		 556 aa  59.7  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  22.54 
 
 		 349 aa  57  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  26.62 
 
 		 373 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  23.56 
 
 		 337 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  25.54 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19188  uroporphyrinogen decarboxylase  28.19 
 
 		 409 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  23.84 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  22.7 
 
 		 353 aa  46.2  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18446  predicted protein  24 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  26.92 
 
 		 343 aa  43.5  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  23.71 
 
 		 448 aa  43.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  26.5 
 
 		 364 aa  43.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  25.87 
 
 		 355 aa  42.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  25.49 
 
 		 358 aa  42.4  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1599  uroporphyrinogen decarboxylase  21.77 
 
 		 368 aa  42.4  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586302  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>