23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_12950 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_12950  Uroporphyrinogen-III decarboxylase  100 
 
 
380 aa  785    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000558347  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.47 
 
 
358 aa  63.9  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  25.68 
 
 
363 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  19.37 
 
 
372 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  24.77 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  24.53 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  25.62 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2957  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  20.6 
 
 
408 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  21.5 
 
 
355 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.5 
 
 
375 aa  50.4  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2886  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  23.67 
 
 
361 aa  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.22 
 
 
338 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0848  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  26.28 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.878025  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  23.68 
 
 
348 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  24.32 
 
 
335 aa  47  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.77 
 
 
345 aa  46.6  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  23.08 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  21.47 
 
 
341 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4338  uroporphyrinogen decarboxylase  28.99 
 
 
354 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332252  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  21.56 
 
 
357 aa  43.9  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  24.32 
 
 
448 aa  43.5  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  25.95 
 
 
402 aa  43.1  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.42 
 
 
310 aa  42.7  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>