34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2957 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2957  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  100 
 
 		 408 aa  853    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2640  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  22.93 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  22.51 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  22.5 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  22.61 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  22.61 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  27.72 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2886  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  23.35 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1110  hypothetical protein  30.08 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2111  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like  25.9 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.71 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1828  hypothetical protein  25.81 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.87 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  25.26 
 
 		 357 aa  59.7  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2801  hypothetical protein  25.57 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.12 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  28.65 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1138  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  26.19 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4642  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  25.26 
 
 		 382 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  26.22 
 
 		 386 aa  53.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  23.68 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12950  Uroporphyrinogen-III decarboxylase  20.6 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000558347  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.15 
 
 		 341 aa  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  20.89 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  25.74 
 
 		 337 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  22.84 
 
 		 338 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1317  hypothetical protein  24.19 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1833  hypothetical protein  26.53 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  25.41 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.73 
 
 		 339 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2125  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  21.29 
 
 		 327 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1314  hypothetical protein  22.43 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.42967 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2963  hypothetical protein  29.01 
 
 		 369 aa  43.1  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0734649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>