237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0452 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  100 
 
 
310 aa  634    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  60.97 
 
 
345 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  51.96 
 
 
341 aa  338  9e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  46.05 
 
 
338 aa  294  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  41.64 
 
 
339 aa  272  6e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  40.66 
 
 
339 aa  242  7e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  33 
 
 
338 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  35.2 
 
 
339 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.88 
 
 
367 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  32.79 
 
 
344 aa  176  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  31.07 
 
 
349 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.55 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.22 
 
 
342 aa  162  7e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  32.89 
 
 
342 aa  158  9e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.34 
 
 
348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  29.72 
 
 
348 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  27.78 
 
 
350 aa  142  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.3 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.7 
 
 
341 aa  127  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  30.66 
 
 
319 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  27.97 
 
 
358 aa  112  6e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  25.24 
 
 
363 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  24.6 
 
 
363 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  24.6 
 
 
363 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  24.35 
 
 
357 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  26.62 
 
 
372 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  33.33 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  25.97 
 
 
348 aa  89.4  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  25.45 
 
 
337 aa  86.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  25.25 
 
 
556 aa  87  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  25.42 
 
 
353 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  27.88 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  24.31 
 
 
356 aa  76.3  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  25.88 
 
 
355 aa  75.9  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  26.4 
 
 
617 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  26.53 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  26.4 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  24.89 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  23.19 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  24.63 
 
 
448 aa  73.2  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  26.38 
 
 
335 aa  72.4  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  26.05 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  28.92 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  23.68 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0079  uroporphyrinogen decarboxylase  23.79 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0659182  hitchhiker  0.00575431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  24.83 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  24.07 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  24.14 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  24.51 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  24.07 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0134  uroporphyrinogen decarboxylase  23.51 
 
 
372 aa  67  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106114  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  24.34 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0422  uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  25.23 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  23.62 
 
 
386 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  23.69 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1823  uroporphyrinogen decarboxylase  24.12 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.952283  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  25.2 
 
 
355 aa  65.9  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  22.66 
 
 
380 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  28.31 
 
 
337 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  23.17 
 
 
355 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  22.71 
 
 
373 aa  64.7  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3524  uroporphyrinogen decarboxylase  24.75 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  22.97 
 
 
340 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  24.59 
 
 
351 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  24.62 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  27.83 
 
 
314 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26160  hypothetical protein  23.92 
 
 
296 aa  63.5  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0705  uroporphyrinogen decarboxylase  23.51 
 
 
365 aa  62.4  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  23.4 
 
 
354 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2887  uroporphyrinogen decarboxylase  22.84 
 
 
354 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1430  uroporphyrinogen decarboxylase  20.74 
 
 
345 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000852244  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  23.4 
 
 
354 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  24.4 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  24.77 
 
 
339 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  25.21 
 
 
348 aa  60.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  25.41 
 
 
351 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  24.77 
 
 
339 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0821  uroporphyrinogen decarboxylase  23.55 
 
 
369 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00198157  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  22.69 
 
 
367 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  24.4 
 
 
351 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  22.1 
 
 
364 aa  60.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  24.3 
 
 
354 aa  60.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3303  uroporphyrinogen decarboxylase  22.31 
 
 
364 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0163615  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2957  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  24.87 
 
 
408 aa  59.7  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3023  uroporphyrinogen decarboxylase  23.48 
 
 
378 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  27.33 
 
 
349 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  22.01 
 
 
365 aa  59.3  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  22.31 
 
 
350 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  23.38 
 
 
354 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0689  uroporphyrinogen decarboxylase  22.27 
 
 
354 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  23 
 
 
354 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  23.26 
 
 
355 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  23.83 
 
 
354 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  22.18 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  23.26 
 
 
354 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3342  uroporphyrinogen decarboxylase  23.55 
 
 
363 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  24 
 
 
351 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1257  uroporphyrinogen decarboxylase  22.41 
 
 
355 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  24.03 
 
 
354 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>