281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0598 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 
335 aa  674    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  36.64 
 
 
372 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  38.53 
 
 
357 aa  226  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  32.54 
 
 
363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  32.54 
 
 
363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  31.95 
 
 
363 aa  195  7e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  32.74 
 
 
375 aa  181  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  30.7 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  32.65 
 
 
337 aa  169  8e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  28.22 
 
 
343 aa  155  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  30.36 
 
 
448 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  30.41 
 
 
319 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  31.15 
 
 
556 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  31.45 
 
 
314 aa  140  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  28.2 
 
 
363 aa  138  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  28.91 
 
 
349 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  32.23 
 
 
373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  30.12 
 
 
338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2887  uroporphyrinogen decarboxylase  27.27 
 
 
354 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.83 
 
 
339 aa  123  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  29.11 
 
 
386 aa  123  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.82 
 
 
339 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.36 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  30.72 
 
 
344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  28.06 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  26.07 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.04 
 
 
345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  26.84 
 
 
348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  26.69 
 
 
617 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  29.54 
 
 
337 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.36 
 
 
339 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.96 
 
 
341 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.33 
 
 
310 aa  97.8  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.96 
 
 
355 aa  89.4  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.69 
 
 
342 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.53 
 
 
342 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.11 
 
 
342 aa  86.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  22.25 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  23.61 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  23.96 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  23.96 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1028  uroporphyrinogen decarboxylase  26.01 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5159  uroporphyrinogen decarboxylase  24.22 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  27.17 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  21.53 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18361  uroporphyrinogen decarboxylase  23.78 
 
 
352 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  20.96 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1147  uroporphyrinogen decarboxylase  23.58 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  22.22 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  24.8 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1216  uroporphyrinogen decarboxylase  23.58 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1314  hypothetical protein  27.16 
 
 
438 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.42967 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  26 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  22.22 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  23.67 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  24.64 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  24.27 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  24.03 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  24.38 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  25.6 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  23.78 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  23.78 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10691  uroporphyrinogen decarboxylase  24.66 
 
 
351 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.88253  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1088  uroporphyrinogen decarboxylase  23.58 
 
 
350 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  26.71 
 
 
354 aa  72  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  24.03 
 
 
355 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  26.44 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  23.51 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2344  uroporphyrinogen decarboxylase  25.23 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.198374 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.2 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  24.44 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  21.68 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0583  uroporphyrinogen decarboxylase  24.65 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  23.55 
 
 
339 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1086  uroporphyrinogen decarboxylase  21.68 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000970328 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  26.07 
 
 
354 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  26.38 
 
 
354 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  26.38 
 
 
354 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  26.38 
 
 
354 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  23.4 
 
 
355 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  25.87 
 
 
354 aa  69.3  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  24.92 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  25.09 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2569  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  31.88 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262106  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2886  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  26.79 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  24.14 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  22.86 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  20.89 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2750  uroporphyrinogen decarboxylase  21.74 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  24.56 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  25.83 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  24.72 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  22.19 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  22.03 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06091  uroporphyrinogen decarboxylase  24.56 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.633731  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  21.68 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  25.47 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  22.26 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  26.07 
 
 
354 aa  67  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>