31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2886 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2886  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  100 
 
 		 361 aa  743    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2640  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  28.31 
 
 		 376 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4642  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  25.19 
 
 		 382 aa  106  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4338  uroporphyrinogen decarboxylase  31.41 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332252  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1110  hypothetical protein  28.04 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  27.85 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  28.31 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  28.31 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  30.07 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  26.79 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5728  hypothetical protein  27.05 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4610  hypothetical protein  27.46 
 
 		 325 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2125  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  25.13 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158481  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2957  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  23.35 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  24.87 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2111  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like  29.33 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  27.27 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  25.58 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1828  hypothetical protein  26.2 
 
 		 331 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2801  hypothetical protein  25.17 
 
 		 301 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2932  hypothetical protein  25 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.29 
 
 		 338 aa  50.1  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12950  Uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.67 
 
 		 380 aa  49.7  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000558347  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  26.13 
 
 		 617 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  21.47 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1897  hypothetical protein  23.28 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  24.93 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1138  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  25 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012636  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  21.29 
 
 		 314 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  22.51 
 
 		 343 aa  43.5  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  23.36 
 
 		 338 aa  42.7  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>