286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3639 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  100 
 
 
339 aa  689    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  76.7 
 
 
339 aa  526  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  65.49 
 
 
338 aa  456  1e-127  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  45.59 
 
 
345 aa  317  1e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  43.53 
 
 
341 aa  290  3e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  41.64 
 
 
310 aa  272  7e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  40.52 
 
 
339 aa  227  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  36.23 
 
 
349 aa  212  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  34.42 
 
 
338 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  36.78 
 
 
344 aa  204  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  35.03 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  35.33 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  32.86 
 
 
348 aa  196  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  34.64 
 
 
342 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.93 
 
 
341 aa  191  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.76 
 
 
367 aa  179  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  29.41 
 
 
350 aa  170  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.67 
 
 
355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  27.38 
 
 
348 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  27.51 
 
 
372 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  25.36 
 
 
363 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  27.38 
 
 
357 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  29.82 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  24.78 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  25.07 
 
 
363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  26.5 
 
 
358 aa  115  7.999999999999999e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  29 
 
 
556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  26.8 
 
 
363 aa  106  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  30 
 
 
319 aa  105  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  28.02 
 
 
337 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0079  uroporphyrinogen decarboxylase  29.68 
 
 
287 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0659182  hitchhiker  0.00575431 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1823  uroporphyrinogen decarboxylase  29.68 
 
 
287 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.952283  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  29.68 
 
 
287 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  30.18 
 
 
448 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  25.95 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  24.44 
 
 
373 aa  94  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0422  uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  29.15 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  26.16 
 
 
339 aa  86.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.84 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  25.87 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  25.47 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  25.58 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  26 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  26.84 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  24.21 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  23.95 
 
 
617 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26160  hypothetical protein  26.52 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  26.48 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  25.43 
 
 
342 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  23.92 
 
 
339 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  23.55 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  25.57 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  25.71 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0946  uroporphyrinogen decarboxylase  26.18 
 
 
341 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  24.29 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  24.93 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  24.93 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  24.29 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0010  uroporphyrinogen decarboxylase  26.98 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717373  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  23.28 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2887  uroporphyrinogen decarboxylase  25.73 
 
 
354 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  22.45 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  25.84 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  24.49 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  27.27 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  23.72 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  24.19 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  23.92 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  27.04 
 
 
351 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0705  uroporphyrinogen decarboxylase  25.86 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  25.85 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1257  uroporphyrinogen decarboxylase  24.09 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  23.93 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  22.65 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2089  uroporphyrinogen decarboxylase  23.48 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  29.18 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  27.85 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  25.43 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0821  uroporphyrinogen decarboxylase  24.19 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00198157  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  26.11 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  24.58 
 
 
354 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  24.23 
 
 
354 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  24.58 
 
 
354 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0134  uroporphyrinogen decarboxylase  26.1 
 
 
372 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106114  normal  0.310056 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02179  uroporphyrinogen decarboxylase  25.9 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03630  uroporphyrinogen decarboxylase  23.68 
 
 
343 aa  64.7  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 
352 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  26.06 
 
 
351 aa  63.9  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3861  uroporphyrinogen decarboxylase  26.67 
 
 
370 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  26.27 
 
 
366 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3134  uroporphyrinogen decarboxylase  25.2 
 
 
370 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0727  uroporphyrinogen decarboxylase  26.05 
 
 
370 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  24.23 
 
 
354 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  26.53 
 
 
359 aa  63.2  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  25.88 
 
 
355 aa  63.2  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  25.88 
 
 
355 aa  63.2  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  23.64 
 
 
356 aa  63.2  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 
339 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  23.36 
 
 
335 aa  62.8  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  23.58 
 
 
356 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.313146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>