279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2082 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  100 
 
 
344 aa  711    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  56.98 
 
 
339 aa  413  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  38.15 
 
 
338 aa  218  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  36.78 
 
 
339 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  34.01 
 
 
345 aa  203  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.14 
 
 
342 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.62 
 
 
341 aa  182  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  36.31 
 
 
339 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  32.07 
 
 
342 aa  179  8e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  32.85 
 
 
342 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  32.79 
 
 
310 aa  176  4e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  30.35 
 
 
338 aa  168  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  32.85 
 
 
367 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.45 
 
 
355 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  30.03 
 
 
350 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  28.7 
 
 
348 aa  155  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  31.58 
 
 
349 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.57 
 
 
341 aa  149  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.2 
 
 
348 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  30.29 
 
 
372 aa  139  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  30.72 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  28.65 
 
 
357 aa  113  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  26.32 
 
 
337 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  28.46 
 
 
448 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  27.27 
 
 
319 aa  99.4  9e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  25.25 
 
 
363 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  24.5 
 
 
363 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  25.25 
 
 
363 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  25.48 
 
 
556 aa  90.5  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  29.32 
 
 
339 aa  89.7  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  29.48 
 
 
340 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  24.72 
 
 
363 aa  87  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  26.79 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  27.46 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  29.79 
 
 
340 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  28.43 
 
 
314 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  22.35 
 
 
358 aa  82.4  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  29.06 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  24.26 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  26.25 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  28.21 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  25.66 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  22.54 
 
 
617 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  26.01 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  22.88 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  26.92 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  24.56 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0079  uroporphyrinogen decarboxylase  26.37 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0659182  hitchhiker  0.00575431 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  25.42 
 
 
352 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  27.45 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  24.51 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1028  uroporphyrinogen decarboxylase  25.07 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1696  uroporphyrinogen decarboxylase  29.06 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.146484  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  26.91 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1823  uroporphyrinogen decarboxylase  25.82 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.952283  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  23.6 
 
 
360 aa  69.3  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  25.41 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  24.48 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  25.58 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17656  predicted protein  23.91 
 
 
339 aa  67  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0099841  normal  0.0141903 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  25.58 
 
 
354 aa  67  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  24.57 
 
 
339 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  27.6 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  25.71 
 
 
365 aa  67  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  25.83 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  25.83 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  28.21 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  26.86 
 
 
354 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  26.38 
 
 
354 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  24.26 
 
 
349 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  25.2 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4014  uroporphyrinogen decarboxylase  27.78 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.0629126 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19188  uroporphyrinogen decarboxylase  23.48 
 
 
409 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  24.25 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  21.22 
 
 
386 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1540  uroporphyrinogen decarboxylase  24.63 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0588582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  28.07 
 
 
340 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  28.31 
 
 
367 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  23.3 
 
 
356 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  24.25 
 
 
354 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  26.5 
 
 
354 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  25.96 
 
 
354 aa  63.5  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  26.09 
 
 
345 aa  63.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  23.81 
 
 
340 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3629  uroporphyrinogen decarboxylase  26.09 
 
 
342 aa  63.5  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2475  uroporphyrinogen decarboxylase  26.48 
 
 
358 aa  63.2  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000149322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  24.51 
 
 
352 aa  63.5  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  25.29 
 
 
354 aa  63.2  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  23.76 
 
 
356 aa  62.8  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  26.55 
 
 
348 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  25.11 
 
 
354 aa  62.8  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  26.05 
 
 
355 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  24.78 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  24.33 
 
 
361 aa  62  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  24.33 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  24.29 
 
 
354 aa  62  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  24.78 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  24.78 
 
 
354 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24090  uroporphyrinogen decarboxylase  24.03 
 
 
353 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.157192  normal  0.0237176 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  26.05 
 
 
355 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>