49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2569 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2569  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  100 
 
 		 371 aa  765    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262106  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2963  hypothetical protein  29.2 
 
 		 369 aa  159  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0734649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1604  hypothetical protein  28.19 
 
 		 414 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000195543  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1314  hypothetical protein  28.88 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.42967 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1317  hypothetical protein  30.67 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2932  hypothetical protein  24.56 
 
 		 397 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0386  hypothetical protein  28.53 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.33173  normal  0.334793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1040  hypothetical protein  25.78 
 
 		 418 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.582207  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1836  hypothetical protein  24.13 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  31.88 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3885  hypothetical protein  25.86 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00209227  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1833  hypothetical protein  24.22 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  28.11 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  29.5 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  23.37 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  21.86 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  26.73 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  28.1 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.87 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  26.78 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2344  uroporphyrinogen decarboxylase  23.62 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.198374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0534  hypothetical protein  26.03 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  26.48 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0721  hypothetical protein  20.65 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.32 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.32 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  24.25 
 
 		 617 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  26.48 
 
 		 340 aa  53.1  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  25.18 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  27.08 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  27.6 
 
 		 340 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  27.78 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  30.08 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  26.17 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  26.43 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  26.43 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2369  hypothetical protein  22.34 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  26.06 
 
 		 363 aa  50.4  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  27.82 
 
 		 319 aa  49.7  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  25.12 
 
 		 339 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  29.32 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.14 
 
 		 310 aa  47  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0425  uroporphyrinogen decarboxylase  26.81 
 
 		 343 aa  47  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0329871 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  23.08 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1216  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1147  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  22.22 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  25 
 
 		 349 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  26.47 
 
 		 337 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>