221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0425 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_0425  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 
343 aa  706    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0329871 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1713  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  54.76 
 
 
349 aa  395  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00218554  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4338  uroporphyrinogen decarboxylase  43.35 
 
 
354 aa  306  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332252  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2344  uroporphyrinogen decarboxylase  27.63 
 
 
352 aa  146  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.198374 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  24.78 
 
 
363 aa  92  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  23.86 
 
 
357 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.37 
 
 
367 aa  89.4  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  25.95 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  22.66 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  25.63 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.42 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  25.32 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  23.18 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  23.18 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  24.92 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  25.46 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  24.92 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.98 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  28.4 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  23.57 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  24.72 
 
 
556 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  25.63 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  23.13 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  21.79 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  24.1 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  27.83 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  28.64 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  23.38 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  26.38 
 
 
448 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  23.84 
 
 
352 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  23.02 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  22.94 
 
 
360 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  27.78 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  22.05 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  22.1 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  21.94 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  21.94 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  30.24 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0848  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  24.13 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.878025  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  24.64 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  22.1 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  21.67 
 
 
354 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4574  uroporphyrinogen decarboxylase  21.98 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.300698 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  24.19 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  24.35 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  21.58 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  21.58 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4028  uroporphyrinogen decarboxylase  21.58 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901601 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  25.74 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  21.58 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  21.58 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  21.58 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4445  uroporphyrinogen decarboxylase  21.58 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531857 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  21.58 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  21.58 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  21.29 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  22.99 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  22.45 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  21.67 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  24.73 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  23.02 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  23.62 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  24.1 
 
 
355 aa  67  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  23.9 
 
 
354 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  22.03 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  22.38 
 
 
353 aa  66.2  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  21.51 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  21.67 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  24.36 
 
 
352 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  24.36 
 
 
352 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3849  uroporphyrinogen decarboxylase  22.74 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  22.58 
 
 
354 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0459  uroporphyrinogen decarboxylase  22.74 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000960348 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1147  uroporphyrinogen decarboxylase  24.51 
 
 
350 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  23.57 
 
 
355 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  23.57 
 
 
355 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4500  uroporphyrinogen decarboxylase  21.22 
 
 
354 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407137 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  21.2 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  23.02 
 
 
354 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  21.79 
 
 
354 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0351  uroporphyrinogen decarboxylase  22.74 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.777116  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  23.15 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1128  uroporphyrinogen decarboxylase  23.72 
 
 
350 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.320103  decreased coverage  0.00101807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  23.62 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4411  uroporphyrinogen decarboxylase  21.22 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.356712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  21.76 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1216  uroporphyrinogen decarboxylase  24.5 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4498  uroporphyrinogen decarboxylase  21.22 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0575835 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  22.99 
 
 
340 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  19.89 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  23.32 
 
 
355 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5159  uroporphyrinogen decarboxylase  23.01 
 
 
350 aa  64.3  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  22.22 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  21.01 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  23.47 
 
 
359 aa  64.3  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4378  uroporphyrinogen decarboxylase  21.22 
 
 
354 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  23.26 
 
 
343 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0918  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 
352 aa  63.9  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763067  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.41 
 
 
345 aa  63.9  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  21.58 
 
 
356 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>