More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0731 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  100 
 
 
319 aa  646    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  38.56 
 
 
556 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  31.58 
 
 
337 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  33.44 
 
 
363 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  33.44 
 
 
363 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  32.48 
 
 
363 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  30.41 
 
 
335 aa  143  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  32.08 
 
 
448 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  28.61 
 
 
358 aa  139  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  29.19 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  26.67 
 
 
357 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  28.53 
 
 
617 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  30.5 
 
 
345 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  30.66 
 
 
310 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  31.5 
 
 
339 aa  122  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  26.8 
 
 
337 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  29.33 
 
 
375 aa  116  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  30.8 
 
 
349 aa  116  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.04 
 
 
367 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  27.64 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.94 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  28.94 
 
 
373 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  30 
 
 
339 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  29.48 
 
 
363 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  26.35 
 
 
338 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2887  uroporphyrinogen decarboxylase  27.56 
 
 
354 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.27 
 
 
344 aa  99.4  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  26.38 
 
 
352 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  27.61 
 
 
343 aa  99  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.94 
 
 
342 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  26.06 
 
 
352 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.47 
 
 
341 aa  97.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0583  uroporphyrinogen decarboxylase  26.62 
 
 
346 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.71 
 
 
342 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  24.84 
 
 
350 aa  96.3  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10691  uroporphyrinogen decarboxylase  26.13 
 
 
351 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.88253  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  26.47 
 
 
346 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.94 
 
 
342 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  26.3 
 
 
346 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06091  uroporphyrinogen decarboxylase  26.14 
 
 
346 aa  93.2  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.633731  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.98 
 
 
355 aa  91.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  27.38 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18361  uroporphyrinogen decarboxylase  24.6 
 
 
352 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0918  uroporphyrinogen decarboxylase  25.41 
 
 
352 aa  89.7  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3039  uroporphyrinogen decarboxylase  26.87 
 
 
360 aa  89.7  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  25.73 
 
 
352 aa  88.6  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.35 
 
 
341 aa  88.6  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  25.32 
 
 
337 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  26.3 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  25.35 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  25.51 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  26.76 
 
 
354 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  26.22 
 
 
349 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.51 
 
 
339 aa  86.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  23.6 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02179  uroporphyrinogen decarboxylase  25.46 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  22.85 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  25.91 
 
 
350 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  22.85 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5159  uroporphyrinogen decarboxylase  27.39 
 
 
350 aa  84  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  25.19 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  25.42 
 
 
354 aa  82.4  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  24.42 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4338  uroporphyrinogen decarboxylase  26.02 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332252  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  24.16 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1713  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  27.61 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00218554  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  24 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28976  predicted protein  25.33 
 
 
365 aa  79.3  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0707495  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1086  uroporphyrinogen decarboxylase  25.58 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000970328 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  23.26 
 
 
356 aa  77  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  24.65 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  23.23 
 
 
364 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2534  uroporphyrinogen decarboxylase  24.58 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0689  uroporphyrinogen decarboxylase  21.94 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  25.67 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0609  uroporphyrinogen decarboxylase  21.82 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884937  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3023  uroporphyrinogen decarboxylase  22.82 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2695  uroporphyrinogen decarboxylase  24.66 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0214736  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0170  uroporphyrinogen decarboxylase  22.9 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  22.9 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  22.9 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0010  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  24.4 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  22.49 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0876  uroporphyrinogen decarboxylase  22.77 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0728  uroporphyrinogen decarboxylase  22.77 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  25.09 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0112  uroporphyrinogen decarboxylase  22.26 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  22.9 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2962  uroporphyrinogen decarboxylase  22.9 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  22.9 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  22.9 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  24.91 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  23.38 
 
 
367 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  23.18 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3292  uroporphyrinogen decarboxylase  23.26 
 
 
392 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.136246  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0848  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  25 
 
 
361 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.878025  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3524  uroporphyrinogen decarboxylase  24.83 
 
 
356 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2344  uroporphyrinogen decarboxylase  24.6 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.198374 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  22.84 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>