213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3585 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  100 
 
 
367 aa  761    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  38.69 
 
 
349 aa  242  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  32.63 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  32.94 
 
 
345 aa  193  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.23 
 
 
339 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.76 
 
 
339 aa  179  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.23 
 
 
341 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  33.88 
 
 
310 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.25 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  32.13 
 
 
348 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  32.85 
 
 
344 aa  163  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  30.18 
 
 
350 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  30.48 
 
 
342 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.83 
 
 
342 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  30.2 
 
 
342 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.49 
 
 
339 aa  149  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.98 
 
 
355 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.71 
 
 
341 aa  130  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.82 
 
 
348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  27.76 
 
 
372 aa  126  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  28.53 
 
 
363 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  25.15 
 
 
357 aa  123  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  28.36 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  27.91 
 
 
358 aa  116  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  28.04 
 
 
319 aa  116  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  27.22 
 
 
363 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  27.59 
 
 
363 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  26.67 
 
 
363 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  27.06 
 
 
375 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  28.19 
 
 
556 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  24.78 
 
 
337 aa  93.6  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  24.08 
 
 
373 aa  90.9  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  30.19 
 
 
343 aa  88.6  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  27.41 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0425  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0329871 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  25.38 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1713  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  24.74 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00218554  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  26.09 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  24.26 
 
 
448 aa  76.3  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  26.14 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  27.35 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1823  uroporphyrinogen decarboxylase  27.35 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.952283  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  25.74 
 
 
354 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  25.2 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  25.74 
 
 
354 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  24.72 
 
 
617 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  30.39 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1430  uroporphyrinogen decarboxylase  21.22 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000852244  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0079  uroporphyrinogen decarboxylase  25.56 
 
 
287 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0659182  hitchhiker  0.00575431 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  26.82 
 
 
314 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  23.98 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6721  Uroporphyrinogen decarboxylase  27.96 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232366  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  23 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  22.89 
 
 
356 aa  67  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  24.9 
 
 
339 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  24.78 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  28.16 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  24.52 
 
 
339 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  24.36 
 
 
353 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  24.9 
 
 
349 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  23.75 
 
 
339 aa  63.5  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  24.83 
 
 
351 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  22.96 
 
 
360 aa  62.8  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1552  uroporphyrinogen decarboxylase  26.27 
 
 
350 aa  62.8  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1028  uroporphyrinogen decarboxylase  24.06 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  24.82 
 
 
401 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1216  uroporphyrinogen decarboxylase  25.07 
 
 
350 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  21.43 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  22.04 
 
 
354 aa  61.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  24.75 
 
 
356 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  26.35 
 
 
345 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  27.94 
 
 
345 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1147  uroporphyrinogen decarboxylase  25.07 
 
 
350 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  20.77 
 
 
354 aa  60.1  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  21.83 
 
 
365 aa  60.1  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2287  uroporphyrinogen decarboxylase  24.37 
 
 
347 aa  60.1  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  23.15 
 
 
340 aa  59.7  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2887  uroporphyrinogen decarboxylase  24.89 
 
 
354 aa  59.7  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  22.81 
 
 
356 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  24.24 
 
 
348 aa  59.3  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  21.52 
 
 
354 aa  59.3  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  21.07 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  20.77 
 
 
354 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  21.41 
 
 
354 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4338  uroporphyrinogen decarboxylase  22.55 
 
 
354 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332252  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  26.1 
 
 
355 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  20.24 
 
 
355 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2263  uroporphyrinogen decarboxylase  25.51 
 
 
354 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  22.41 
 
 
354 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  21.73 
 
 
354 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  22.46 
 
 
360 aa  57.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  25.56 
 
 
340 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  21.74 
 
 
354 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  21.71 
 
 
354 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  24.8 
 
 
356 aa  57.4  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4642  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  25.14 
 
 
382 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  21.71 
 
 
354 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  25.68 
 
 
342 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  21.71 
 
 
354 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  22.1 
 
 
354 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>