188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1713 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1713  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  100 
 
 
349 aa  709    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00218554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0425  uroporphyrinogen decarboxylase  54.76 
 
 
343 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0329871 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4338  uroporphyrinogen decarboxylase  40.74 
 
 
354 aa  287  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332252  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2344  uroporphyrinogen decarboxylase  29.67 
 
 
352 aa  146  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.198374 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  24.49 
 
 
363 aa  98.6  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  26.95 
 
 
375 aa  90.1  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  25.56 
 
 
363 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  23.27 
 
 
357 aa  86.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0848  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  26.24 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.878025  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  24.52 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  24.6 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  26.74 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  27.61 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.74 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  26.43 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  24.63 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  22.96 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  26.75 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  21.76 
 
 
353 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  26.63 
 
 
617 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  21.01 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  22.3 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  26.17 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2386  methylcobamide:CoM methyltransferase-related protein  22.88 
 
 
341 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.8 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  22.46 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  23.64 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.03 
 
 
358 aa  65.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  24.86 
 
 
352 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  23.84 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  21.94 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  22.29 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  23.86 
 
 
351 aa  64.3  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  23.24 
 
 
361 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  23.24 
 
 
402 aa  63.9  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  23.21 
 
 
355 aa  63.5  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  24.43 
 
 
351 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  22.22 
 
 
367 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.9 
 
 
339 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  22.22 
 
 
367 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  23.32 
 
 
350 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  21.51 
 
 
354 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  21.84 
 
 
556 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  21.74 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  23.23 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  23.7 
 
 
353 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  22.86 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.39 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  21.51 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  22.83 
 
 
339 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  21.89 
 
 
354 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1257  uroporphyrinogen decarboxylase  21.53 
 
 
355 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3303  uroporphyrinogen decarboxylase  21.88 
 
 
364 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0163615  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  23.86 
 
 
356 aa  60.1  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  22.22 
 
 
340 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.22 
 
 
344 aa  60.5  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  22.1 
 
 
355 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  21.85 
 
 
380 aa  59.7  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3491  uroporphyrinogen decarboxylase  21.63 
 
 
367 aa  59.3  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000153179  normal  0.770244 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.68 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  21.15 
 
 
354 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  22.26 
 
 
355 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  19.42 
 
 
357 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  22.37 
 
 
348 aa  58.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  20.86 
 
 
354 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.69 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1128  uroporphyrinogen decarboxylase  24.32 
 
 
350 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.320103  decreased coverage  0.00101807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  21.22 
 
 
354 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  23.3 
 
 
351 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  23.03 
 
 
365 aa  57.4  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1314  hypothetical protein  24.24 
 
 
438 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.42967 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  22.73 
 
 
351 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  23.27 
 
 
335 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  21.22 
 
 
354 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  21.15 
 
 
354 aa  57  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  21.27 
 
 
340 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2962  uroporphyrinogen decarboxylase  19.22 
 
 
405 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3713  uroporphyrinogen decarboxylase  20.79 
 
 
360 aa  56.6  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  20.74 
 
 
340 aa  56.6  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0170  uroporphyrinogen decarboxylase  19.22 
 
 
405 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1216  uroporphyrinogen decarboxylase  22.52 
 
 
350 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1088  uroporphyrinogen decarboxylase  23.28 
 
 
350 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1147  uroporphyrinogen decarboxylase  22.52 
 
 
350 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  21.3 
 
 
354 aa  56.2  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4036  uroporphyrinogen decarboxylase  19.57 
 
 
364 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617261  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1028  uroporphyrinogen decarboxylase  25.64 
 
 
338 aa  56.2  0.0000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  19.22 
 
 
364 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  19.22 
 
 
364 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  19.22 
 
 
364 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  24.7 
 
 
448 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3890  uroporphyrinogen decarboxylase  20.22 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  21.61 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  19.22 
 
 
364 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  22.18 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02733  uroporphyrinogen decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_1G05060)  22.29 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  19.22 
 
 
364 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  23.08 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  24.08 
 
 
342 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0044  uroporphyrinogen decarboxylase  19.86 
 
 
366 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629756  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.24 
 
 
342 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>