214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0196 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  100 
 
 
335 aa  678    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  39.22 
 
 
337 aa  256  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  27.73 
 
 
372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  27.3 
 
 
357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  28.06 
 
 
335 aa  125  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  24.71 
 
 
363 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  24.93 
 
 
363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  27.64 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  24.12 
 
 
363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  27 
 
 
375 aa  113  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  26.03 
 
 
556 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.41 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.9 
 
 
339 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  24.12 
 
 
448 aa  89.4  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  25.66 
 
 
363 aa  89.4  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.2 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.32 
 
 
358 aa  87.8  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  24.32 
 
 
343 aa  86.3  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.15 
 
 
342 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1430  uroporphyrinogen decarboxylase  24.29 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000852244  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2887  uroporphyrinogen decarboxylase  27.36 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  22.85 
 
 
342 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  26.62 
 
 
338 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  22.85 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.52 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.42 
 
 
348 aa  79.3  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.38 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1028  uroporphyrinogen decarboxylase  27.57 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  25.43 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  24.19 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3476  uroporphyrinogen decarboxylase  23.51 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  25.37 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.56 
 
 
344 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  25.84 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.46 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0010  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  24.17 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  23.73 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  25.21 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  23.12 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6783  uroporphyrinogen decarboxylase  25.66 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.916687  normal  0.894439 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0030  uroporphyrinogen decarboxylase  23.33 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  26.13 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  23.76 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  24.18 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.36 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  20.79 
 
 
353 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3208  uroporphyrinogen decarboxylase  23.08 
 
 
343 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.74 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  24.6 
 
 
380 aa  64.3  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  22.82 
 
 
617 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  22.22 
 
 
354 aa  63.9  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2386  methylcobamide:CoM methyltransferase-related protein  24.56 
 
 
341 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.98 
 
 
339 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02179  uroporphyrinogen decarboxylase  23.78 
 
 
354 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  23.53 
 
 
356 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0848  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  24.72 
 
 
361 aa  60.8  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.878025  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  22.3 
 
 
345 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17656  predicted protein  21.63 
 
 
339 aa  60.1  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0099841  normal  0.0141903 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1713  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  23.27 
 
 
349 aa  59.7  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00218554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  23.81 
 
 
345 aa  60.1  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  21.12 
 
 
351 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  24.01 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  21.43 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  22.22 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0118  uroporphyrinogen decarboxylase  23.13 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  22.48 
 
 
354 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1382  uroporphyrinogen decarboxylase  24.16 
 
 
368 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0660035  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0968  uroporphyrinogen decarboxylase  20.9 
 
 
324 aa  57.4  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1763  uroporphyrinogen decarboxylase  25.33 
 
 
354 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000856946  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  21.38 
 
 
354 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  21.94 
 
 
354 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  21.64 
 
 
354 aa  57.4  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1216  uroporphyrinogen decarboxylase  20.93 
 
 
350 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1147  uroporphyrinogen decarboxylase  21.33 
 
 
350 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  21.68 
 
 
354 aa  57  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  21.24 
 
 
354 aa  56.6  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  21.45 
 
 
354 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16140  uroporphyrinogen decarboxylase  20.98 
 
 
366 aa  56.6  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.943071  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  22.04 
 
 
354 aa  56.2  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2260  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  21.7 
 
 
330 aa  56.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000313707  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1258  uroporphyrinogen decarboxylase  21.93 
 
 
325 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  21.89 
 
 
355 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2103  uroporphyrinogen decarboxylase  25.15 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00554652  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  23.15 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  22.58 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2830  uroporphyrinogen decarboxylase  24.04 
 
 
355 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33915  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.37 
 
 
355 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  23.36 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  21.45 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  21.05 
 
 
354 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  24.08 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  21.45 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  24.08 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  22.65 
 
 
355 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  22.22 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  22.22 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  22.22 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  23.03 
 
 
364 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  21.45 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  21.05 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>